More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0932 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  71.23 
 
 		 173 aa  221  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  73.47 
 
 		 153 aa  221  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  72.79 
 
 		 151 aa  219  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  70.47 
 
 		 151 aa  216  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  67.35 
 
 		 166 aa  205  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  68.53 
 
 		 162 aa  196  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.05 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.91 
 
 		 138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.28 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.17 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.68 
 
 		 150 aa  140  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.52 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.01 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 145 aa  137  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.92 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 		 159 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.21 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  43.75 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.39 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  46.94 
 
 		 152 aa  133  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.95 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 146 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  51.37 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.55 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  46.41 
 
 		 193 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.99 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 145 aa  126  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 		 176 aa  126  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  52.27 
 
 		 145 aa  126  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.48 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.43 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>