More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0858 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0858  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00112891  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1035  amino acid ABC transporter periplasmic protein  99.62 
 
 
260 aa  522  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1178  amino acid ABC transporter periplasmic protein  71.09 
 
 
265 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.241034  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0740  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems periplasmic component/domain-like protein  65.35 
 
 
261 aa  347  8e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2022  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.14 
 
 
748 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  35.62 
 
 
990 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  35.62 
 
 
990 aa  145  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0714  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.69 
 
 
755 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0860  amino acid ABC transporter permease  35.05 
 
 
508 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00720787  normal  0.228592 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1037  amino acid ABC transporter permease  35.05 
 
 
508 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42517  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0739  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
515 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0847  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.53 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  41.24 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
246 aa  85.9  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  24.69 
 
 
727 aa  85.9  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  46.24 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  38.98 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  39.62 
 
 
310 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  43.62 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  42.53 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  44.19 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  47.73 
 
 
244 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  47.73 
 
 
244 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2278  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000861711  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  40.59 
 
 
249 aa  82  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  52.94 
 
 
242 aa  82  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  40.23 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  40.23 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.67 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  48.84 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  33.68 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  46.07 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  46.51 
 
 
244 aa  79  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0296  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  37.74 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.511931  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  46.51 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  46.51 
 
 
244 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  46.51 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  46.51 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  46.51 
 
 
250 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  41.05 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  40.66 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  41.49 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  42.05 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  38.95 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  47.06 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  48.84 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  35.79 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  36.96 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  37.65 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  42.53 
 
 
489 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.53 
 
 
489 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.53 
 
 
489 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  39.56 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  41.49 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  44.83 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  35.19 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  47.06 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  36.08 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  36.84 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  42.05 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  34.74 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  42.7 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  48.24 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  42.35 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.86 
 
 
503 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4629  arginine-binding periplasmic protein 2  36.56 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336124  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4748  arginine-binding periplasmic protein 2  36.56 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4769  arginine-binding periplasmic protein 2  36.56 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129317  normal  0.0665997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  44.74 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  44.94 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4712  arginine-binding periplasmic protein 2  36.56 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00168872  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40.66 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  38.55 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40.66 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.78 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40.66 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.56 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4620  arginine-binding periplasmic protein 2  36.56 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.7 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>