18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0855 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0855  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  490  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.110269  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0562  hypothetical protein  53.51 
 
 
205 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.916789  normal  0.708771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0610  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.26 
 
 
323 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.828743  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  37.8 
 
 
175 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1569  protoporphyrinogen oxidase  28 
 
 
170 aa  46.6  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838772  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2977  protoporphyrinogen oxidase  22.98 
 
 
174 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  27.45 
 
 
215 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  24.39 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.89 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 
177 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  23.66 
 
 
160 aa  43.5  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  26.95 
 
 
164 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3493  hypothetical protein  38.6 
 
 
176 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  21.05 
 
 
173 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  27.03 
 
 
175 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000384734  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  33.93 
 
 
335 aa  42.4  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  31.91 
 
 
216 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  21.05 
 
 
173 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>