21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0706 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  227  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  71.05 
 
 
114 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  49.15 
 
 
120 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  56.04 
 
 
101 aa  100  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  57.65 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  57.65 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  57.65 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  54.35 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  52.75 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  54.12 
 
 
113 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3257  gas vesicle K  50.6 
 
 
110 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.224981 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3575  putative gas vesicle synthesis protein  50.6 
 
 
110 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  51.9 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  45.24 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  42.31 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0072  gas vesicle K  38.46 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  33.8 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  34.67 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  34.78 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  37.5 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4009  gas vesicle K  34.12 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.910553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>