60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0704 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  72.41 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2408  gas vesicle protein GVPa  55.93 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  54.72 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  58.33 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  58.33 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  58.33 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  47.17 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  44.44 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  52.73 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  46.77 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  58.14 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  40.32 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  43.86 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  39.39 
 
 		 181 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  44.83 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  45.83 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  48.98 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  56.1 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  52.38 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  56.1 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  40.3 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  48.84 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  47.06 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  42.59 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  47.92 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  38.3 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  46.43 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  47.92 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  37.7 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  46.34 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  44.23 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  37.7 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  42.22 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  47.92 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  40.82 
 
 		 126 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2366  gas vesicle protein GVPa  45.65 
 
 		 142 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  40.82 
 
 		 126 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.98 
 
 		 72 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  40.68 
 
 		 75 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  40.82 
 
 		 126 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  40.98 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  31.82 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.82 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.82 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.82 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.82 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.82 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.82 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.54 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  39.34 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.82 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.18 
 
 		 70 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.18 
 
 		 70 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  35.71 
 
 		 157 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>