More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0609 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  63.69 
 
 
557 aa  727    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  59.82 
 
 
559 aa  646    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  56.89 
 
 
562 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  63.69 
 
 
557 aa  727    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  58.14 
 
 
554 aa  668    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  60.36 
 
 
569 aa  700    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  86.37 
 
 
565 aa  994    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  63.51 
 
 
557 aa  724    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  63.33 
 
 
557 aa  724    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  63.69 
 
 
557 aa  724    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  63.33 
 
 
557 aa  722    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  63.33 
 
 
557 aa  724    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  63.69 
 
 
557 aa  729    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  63.73 
 
 
557 aa  724    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  82.83 
 
 
566 aa  956    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
565 aa  1144    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  85.97 
 
 
559 aa  977    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  56.94 
 
 
554 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  63.51 
 
 
557 aa  724    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  55.6 
 
 
561 aa  637    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  56.99 
 
 
558 aa  652    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  85.84 
 
 
565 aa  998    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  61.14 
 
 
557 aa  687    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  56.17 
 
 
562 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  58.21 
 
 
561 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  59.07 
 
 
552 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  63.51 
 
 
557 aa  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  80.54 
 
 
579 aa  917    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  57.27 
 
 
558 aa  639    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  58.93 
 
 
613 aa  659    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  62.84 
 
 
558 aa  726    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  56.17 
 
 
562 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  56.73 
 
 
580 aa  660    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  56.79 
 
 
555 aa  635    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  85.13 
 
 
565 aa  984    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  62.84 
 
 
559 aa  719    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  59.35 
 
 
557 aa  681    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  58.93 
 
 
558 aa  661    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  58.14 
 
 
561 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  57.17 
 
 
554 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  56.96 
 
 
555 aa  632  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  57.65 
 
 
560 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  56.91 
 
 
552 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  56.89 
 
 
557 aa  633  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  58.19 
 
 
560 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  56.41 
 
 
559 aa  634  1e-180  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  56.61 
 
 
555 aa  629  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  57.09 
 
 
552 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  56.81 
 
 
577 aa  628  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  57.12 
 
 
560 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  54.88 
 
 
562 aa  621  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  56.83 
 
 
556 aa  619  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  55.56 
 
 
557 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  55.2 
 
 
553 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  56.53 
 
 
582 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  55.4 
 
 
553 aa  609  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  56.35 
 
 
557 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  56.19 
 
 
551 aa  608  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  56.09 
 
 
553 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  55.94 
 
 
554 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  53.49 
 
 
554 aa  595  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  53.41 
 
 
558 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 
558 aa  591  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  53.31 
 
 
554 aa  593  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  55.64 
 
 
557 aa  594  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  53.05 
 
 
558 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  53.87 
 
 
552 aa  590  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  54.3 
 
 
556 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  55.46 
 
 
557 aa  587  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  53.13 
 
 
555 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  54.2 
 
 
555 aa  586  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  52.87 
 
 
556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  54.74 
 
 
550 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  53.85 
 
 
554 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 
550 aa  581  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 
560 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  53.23 
 
 
558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  52.15 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  54.74 
 
 
550 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  54.03 
 
 
550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  52.14 
 
 
553 aa  571  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  52.34 
 
 
553 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3508  dihydroxy-acid dehydratase  50.25 
 
 
616 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1344  dihydroxy-acid dehydratase  51.55 
 
 
618 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  52.48 
 
 
563 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2538  dihydroxy-acid dehydratase  50.74 
 
 
612 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7332  Dihydroxy-acid dehydratase  50.58 
 
 
612 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4235  dihydroxy-acid dehydratase  49.09 
 
 
616 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.866608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4129  dihydroxy-acid dehydratase  49.09 
 
 
616 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03649  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
616 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000570599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4205  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
616 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00333285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
616 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4231  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
616 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604372  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4282  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
616 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5205  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
616 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03598  hypothetical protein  48.93 
 
 
616 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000482952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4186  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
616 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4114  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
616 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4294  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
616 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4149  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
616 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>