More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0581 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  100 
 
 
224 aa  471  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  84.82 
 
 
224 aa  410  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  82.14 
 
 
225 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  82.06 
 
 
223 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  82.65 
 
 
221 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  72.85 
 
 
225 aa  368  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  72.86 
 
 
215 aa  342  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  65.26 
 
 
220 aa  315  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  66.67 
 
 
213 aa  310  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  63.03 
 
 
216 aa  302  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  64.42 
 
 
215 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  63.01 
 
 
221 aa  299  3e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  61.32 
 
 
212 aa  295  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  61.14 
 
 
215 aa  294  8e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  60.66 
 
 
215 aa  293  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.84 
 
 
225 aa  290  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  61.03 
 
 
212 aa  290  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  61.06 
 
 
213 aa  287  8e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  59.53 
 
 
223 aa  278  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.41 
 
 
220 aa  275  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  54.88 
 
 
215 aa  267  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  54.38 
 
 
225 aa  266  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  56.68 
 
 
226 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.87 
 
 
224 aa  258  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  54.88 
 
 
213 aa  256  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  55.71 
 
 
217 aa  255  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  56.36 
 
 
217 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  55.66 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.19 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  54.79 
 
 
217 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  54.79 
 
 
217 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  52.13 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.29 
 
 
215 aa  241  6e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  50 
 
 
232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.82 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  48.11 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  48.37 
 
 
214 aa  207  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  48.4 
 
 
213 aa  207  8e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  47.96 
 
 
214 aa  204  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  48.42 
 
 
219 aa  204  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  46.36 
 
 
229 aa  201  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  45.05 
 
 
240 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  47.42 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  44.93 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  44 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  45.28 
 
 
223 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  44.04 
 
 
226 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  45.28 
 
 
214 aa  191  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  43.56 
 
 
230 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  42.66 
 
 
216 aa  185  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  48.11 
 
 
217 aa  181  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  42.92 
 
 
241 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  47.95 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.81 
 
 
213 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  42.33 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  42.65 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  47.12 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  41.4 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  42.16 
 
 
221 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  46.7 
 
 
212 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.55 
 
 
217 aa  160  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  42.16 
 
 
221 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  42.41 
 
 
211 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  42.41 
 
 
211 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  41.59 
 
 
217 aa  159  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  45 
 
 
211 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  46.6 
 
 
208 aa  157  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  44.5 
 
 
212 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  34.09 
 
 
234 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  41.38 
 
 
213 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.63 
 
 
217 aa  156  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  39.91 
 
 
215 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  46.15 
 
 
212 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  38.61 
 
 
215 aa  156  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  44.5 
 
 
212 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  43.43 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  43.92 
 
 
208 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  40.91 
 
 
212 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  44.57 
 
 
213 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  40.91 
 
 
212 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  43.43 
 
 
212 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  44.5 
 
 
213 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  45 
 
 
212 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  46.71 
 
 
212 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  45.03 
 
 
210 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  40.61 
 
 
212 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  43.98 
 
 
212 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  45.05 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  41.92 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  40.91 
 
 
261 aa  152  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  43.46 
 
 
209 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  45.56 
 
 
212 aa  152  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  44.44 
 
 
213 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  42.42 
 
 
212 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  46.15 
 
 
212 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  42.42 
 
 
212 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  41.92 
 
 
212 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  43.46 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  41.92 
 
 
212 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  41.92 
 
 
212 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>