More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0571 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  58.02 
 
 
610 aa  741    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  55.59 
 
 
640 aa  723    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
634 aa  1280    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  66.43 
 
 
647 aa  808    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  62.89 
 
 
646 aa  828    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  68.9 
 
 
641 aa  841    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  62.2 
 
 
643 aa  798    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  41.91 
 
 
615 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 
643 aa  347  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  35.68 
 
 
646 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 
636 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 
634 aa  337  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.4 
 
 
645 aa  336  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.23 
 
 
645 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.59 
 
 
639 aa  335  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 
647 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 
642 aa  329  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  35.09 
 
 
648 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  36.09 
 
 
681 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  33.28 
 
 
801 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  34.8 
 
 
636 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  31.9 
 
 
801 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  31.9 
 
 
801 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  33.23 
 
 
766 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  35.14 
 
 
619 aa  315  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
651 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  32.41 
 
 
661 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
678 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
655 aa  313  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 
600 aa  313  7.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
703 aa  312  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  32.13 
 
 
793 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  33.71 
 
 
679 aa  311  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  33.56 
 
 
596 aa  310  6.999999999999999e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  33.12 
 
 
635 aa  309  8e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  33.92 
 
 
771 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 
632 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  34.73 
 
 
622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  32.57 
 
 
803 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  32.57 
 
 
809 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 
800 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  32.57 
 
 
803 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  33.38 
 
 
655 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  32.57 
 
 
802 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
657 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.23 
 
 
618 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 
767 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  32.9 
 
 
775 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  32.46 
 
 
802 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  32.46 
 
 
802 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  32.46 
 
 
802 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  32.46 
 
 
802 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  31.97 
 
 
760 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
765 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
765 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  33.23 
 
 
635 aa  303  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 
673 aa  303  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  32.58 
 
 
761 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
618 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  31.95 
 
 
756 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  33.5 
 
 
640 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 
764 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
618 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
618 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 
650 aa  300  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.07 
 
 
574 aa  300  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 
637 aa  300  7e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
618 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.23 
 
 
662 aa  298  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3202  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.38 
 
 
654 aa  297  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000159747  normal  0.0376991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 
683 aa  297  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  35.65 
 
 
630 aa  296  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
609 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  33.45 
 
 
618 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
618 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
618 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
618 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 
633 aa  294  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 
648 aa  293  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.9 
 
 
664 aa  292  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  34.64 
 
 
586 aa  292  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  33.62 
 
 
619 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  33.55 
 
 
652 aa  291  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  35.54 
 
 
664 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 
610 aa  290  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  33.89 
 
 
621 aa  289  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  32.78 
 
 
602 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  32.78 
 
 
602 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
618 aa  289  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  32.82 
 
 
607 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  34.61 
 
 
687 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  34.61 
 
 
687 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 
627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  33.23 
 
 
681 aa  284  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 
627 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 
618 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  35.27 
 
 
626 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
663 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  32.05 
 
 
646 aa  281  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  31.64 
 
 
612 aa  281  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>