13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0530 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0530  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  411  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000151796  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0842  hypothetical protein  66.67 
 
 
215 aa  264  8e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3145  hypothetical protein  40.31 
 
 
223 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0724  hypothetical protein  43.92 
 
 
240 aa  145  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255555  normal  0.0372103 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20900  hypothetical protein  40.4 
 
 
216 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3401  hypothetical protein  37.82 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1718  von Willebrand factor type A  39.15 
 
 
211 aa  125  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5577  von Willebrand factor type A  39.52 
 
 
215 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1750  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.76 
 
 
231 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.161961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0193  hypothetical protein  35.53 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0762  von Willebrand factor type A  33.69 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.915721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5886  hypothetical protein  33.77 
 
 
110 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  hitchhiker  0.00718137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1694  hypothetical protein  31.82 
 
 
122 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.299884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>