276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0430 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  61.01 
 
 		 220 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  61.75 
 
 		 223 aa  277  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  56.88 
 
 		 226 aa  264  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  59.64 
 
 		 223 aa  263  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  54.46 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  55.5 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  45.79 
 
 		 212 aa  194  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  46.92 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  49.07 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  46.51 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  46.36 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  45.5 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  44.08 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  45.5 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  43.46 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  45.5 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  41.23 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  42.72 
 
 		 212 aa  175  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  45.5 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  45.5 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  42.18 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  42.18 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  44.55 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  40.76 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  42.79 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  43.26 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  45.28 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  44.81 
 
 		 264 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  42.15 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  44.34 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  41.51 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  41.04 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  41.04 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  41.51 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  41.51 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  40.85 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  40.71 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  41.04 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  39.17 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  38.5 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  38.5 
 
 		 244 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  38.01 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  35.32 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  39.9 
 
 		 193 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  35.62 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  32.23 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  36.02 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  32.7 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  32.7 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  34.68 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  34.95 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  40 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  42 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  27.07 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  26.45 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  37.96 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  28.38 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.73 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  34.57 
 
 		 274 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  27.84 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  27.27 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  41.05 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.09 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  29.31 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  29.14 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.69 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  32.61 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  28.93 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  27.27 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  36 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  39.73 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  32.86 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  27.43 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  30.66 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  26.84 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  41.98 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  35.62 
 
 		 251 aa  62  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>