More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0404 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  100 
 
 
288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  74.31 
 
 
288 aa  428  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  71.88 
 
 
288 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  73.96 
 
 
288 aa  418  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  69.69 
 
 
288 aa  409  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  70.14 
 
 
288 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  61.67 
 
 
288 aa  358  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  48.07 
 
 
276 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  45.1 
 
 
303 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  44.76 
 
 
303 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  42.31 
 
 
279 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.11 
 
 
303 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  45.45 
 
 
294 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  42.31 
 
 
293 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  43.4 
 
 
292 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  37.71 
 
 
311 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  43.06 
 
 
292 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  40.21 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.86 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  41.96 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  41.64 
 
 
294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  43.77 
 
 
290 aa  199  6e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  40.35 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  39.51 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.41 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  42.66 
 
 
294 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  41.98 
 
 
278 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  37.07 
 
 
312 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  37.54 
 
 
299 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  40.54 
 
 
292 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  40.61 
 
 
286 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  39.73 
 
 
312 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  39.52 
 
 
287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  40.62 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  40.62 
 
 
292 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  37.84 
 
 
313 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  39.65 
 
 
294 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  39.31 
 
 
302 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  39.38 
 
 
276 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  41.38 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  39.86 
 
 
303 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  39.44 
 
 
277 aa  187  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  40.35 
 
 
292 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  39.12 
 
 
286 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  40.35 
 
 
292 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  40.35 
 
 
292 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  38.21 
 
 
314 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  39.8 
 
 
272 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  37.68 
 
 
278 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  38.44 
 
 
307 aa  186  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  37.01 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  39.25 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  39.12 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  37.76 
 
 
307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  40.13 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  37.41 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  37.84 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  41.4 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  38.38 
 
 
277 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  37.89 
 
 
292 aa  183  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  39.86 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  42.01 
 
 
295 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.33 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  39.46 
 
 
308 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  36.82 
 
 
308 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  41.14 
 
 
308 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2734  translation elongation factor Ts  35.19 
 
 
284 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450458  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  39.32 
 
 
278 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  36.49 
 
 
290 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  41.46 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  41.46 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  41.46 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  41.46 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  41.46 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  41.11 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  39.24 
 
 
286 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  41.11 
 
 
295 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  41.11 
 
 
295 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  36.73 
 
 
277 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  41.11 
 
 
295 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  38.46 
 
 
308 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  36.86 
 
 
307 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  42.01 
 
 
295 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  39.86 
 
 
309 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  37.25 
 
 
312 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  39.62 
 
 
286 aa  176  4e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  36.39 
 
 
307 aa  176  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  41.96 
 
 
290 aa  175  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  36.3 
 
 
310 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  37.76 
 
 
274 aa  175  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  36.73 
 
 
308 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  38.06 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  39.58 
 
 
292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  36.15 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  38.41 
 
 
291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  39.73 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  39.73 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  39.45 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  39.45 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.4 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>