More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0350 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.16 
 
 
706 aa  885    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
703 aa  1419    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.02 
 
 
706 aa  891    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.06 
 
 
719 aa  817    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.59 
 
 
712 aa  818    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.41 
 
 
706 aa  984    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.97 
 
 
707 aa  873    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.72 
 
 
700 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.79 
 
 
714 aa  559  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.32 
 
 
772 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.6 
 
 
829 aa  555  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.45 
 
 
765 aa  554  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.36 
 
 
772 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.4 
 
 
704 aa  555  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.87 
 
 
767 aa  548  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.68 
 
 
717 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.96 
 
 
778 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.8 
 
 
698 aa  535  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.21 
 
 
904 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 
702 aa  532  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.7 
 
 
703 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.65 
 
 
786 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 
819 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  40.97 
 
 
700 aa  528  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 
819 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.78 
 
 
772 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.06 
 
 
685 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.29 
 
 
701 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 
779 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.36 
 
 
706 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.02 
 
 
696 aa  519  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.35 
 
 
904 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.55 
 
 
818 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.41 
 
 
685 aa  512  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 
695 aa  509  1e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.87 
 
 
702 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 
817 aa  505  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.66 
 
 
689 aa  502  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  39.83 
 
 
818 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.77 
 
 
818 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.62 
 
 
827 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.15 
 
 
740 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.89 
 
 
692 aa  492  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.5 
 
 
683 aa  491  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.07 
 
 
815 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.81 
 
 
862 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.49 
 
 
694 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.62 
 
 
908 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.24 
 
 
827 aa  474  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 
822 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.3 
 
 
681 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.82 
 
 
688 aa  472  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.23 
 
 
822 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.69 
 
 
842 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.01 
 
 
842 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.51 
 
 
680 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.33 
 
 
832 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.3 
 
 
679 aa  465  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.64 
 
 
776 aa  464  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 
763 aa  465  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 
812 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.7 
 
 
779 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.96 
 
 
818 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.17 
 
 
815 aa  459  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.43 
 
 
805 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.33 
 
 
701 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.97 
 
 
773 aa  457  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.31 
 
 
678 aa  452  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.66 
 
 
818 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.26 
 
 
818 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.85 
 
 
753 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.64 
 
 
689 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.17 
 
 
787 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.15 
 
 
781 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.93 
 
 
790 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.17 
 
 
686 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.83 
 
 
701 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 
706 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.82 
 
 
692 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.55 
 
 
733 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.37 
 
 
691 aa  449  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.3 
 
 
701 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.16 
 
 
682 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.57 
 
 
702 aa  444  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.11 
 
 
692 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.49 
 
 
684 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 
691 aa  446  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.58 
 
 
693 aa  445  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.18 
 
 
681 aa  443  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.96 
 
 
692 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.26 
 
 
671 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 
706 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.96 
 
 
693 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.44 
 
 
846 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.37 
 
 
846 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 
706 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.3 
 
 
678 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.11 
 
 
692 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.96 
 
 
693 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 
693 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>