More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0298 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  52.1 
 
 
861 aa  799  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  49.49 
 
 
813 aa  760  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  44.14 
 
 
825 aa  672  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  42.88 
 
 
813 aa  640  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  43.02 
 
 
819 aa  658  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  51.26 
 
 
811 aa  827  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  44.33 
 
 
798 aa  683  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  43.73 
 
 
803 aa  669  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  42.2 
 
 
814 aa  661  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  100 
 
 
799 aa  1628  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  44.33 
 
 
811 aa  683  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.35674e-05  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  50.83 
 
 
832 aa  796  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.37 
 
 
801 aa  736  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.77 
 
 
865 aa  656  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  46.88 
 
 
806 aa  696  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  44.75 
 
 
815 aa  691  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  46.03 
 
 
818 aa  687  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  68.31 
 
 
803 aa  1124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  63.11 
 
 
808 aa  1060  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  46.19 
 
 
814 aa  700  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  50.25 
 
 
844 aa  796  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  62.86 
 
 
809 aa  1040  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.58 
 
 
813 aa  716  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.56 
 
 
805 aa  687  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  43.14 
 
 
819 aa  662  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  47.46 
 
 
819 aa  691  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  44.75 
 
 
821 aa  683  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  46.56 
 
 
809 aa  681  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.43 
 
 
805 aa  644  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  52.84 
 
 
803 aa  844  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.51 
 
 
806 aa  681  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.27 
 
 
843 aa  775  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  41.4 
 
 
787 aa  631  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.16 
 
 
786 aa  627  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.25582e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.24 
 
 
802 aa  622  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  40.15 
 
 
810 aa  618  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  39.65 
 
 
823 aa  613  1e-174  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  41.73 
 
 
817 aa  614  1e-174  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  42.64 
 
 
806 aa  613  1e-174  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.62 
 
 
807 aa  611  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  39.59 
 
 
827 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  40.59 
 
 
786 aa  609  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  40.18 
 
 
817 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  40.31 
 
 
817 aa  611  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  40.56 
 
 
806 aa  607  1e-172  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  40.38 
 
 
786 aa  607  1e-172  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  40.03 
 
 
811 aa  607  1e-172  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  41.03 
 
 
829 aa  607  1e-172  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.80038e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  40.15 
 
 
811 aa  608  1e-172  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  40.59 
 
 
786 aa  604  1e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  38.5 
 
 
801 aa  603  1e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  39.65 
 
 
831 aa  602  1e-171  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.65888e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.24 
 
 
810 aa  599  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.84 
 
 
805 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.84 
 
 
805 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  39.8 
 
 
812 aa  592  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  39.29 
 
 
807 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  40.84 
 
 
805 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  39.02 
 
 
800 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.51631e-05  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.71 
 
 
805 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  38.9 
 
 
812 aa  583  1e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.39 
 
 
812 aa  585  1e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  39.16 
 
 
812 aa  583  1e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  39.16 
 
 
812 aa  583  1e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.1 
 
 
805 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  40.1 
 
 
805 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  39.43 
 
 
795 aa  581  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  39.97 
 
 
805 aa  581  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.24 
 
 
816 aa  576  1e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  39.9 
 
 
786 aa  578  1e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  40.3 
 
 
873 aa  573  1e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  39.32 
 
 
806 aa  573  1e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  39.95 
 
 
810 aa  569  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.92 
 
 
788 aa  565  1e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  37.18 
 
 
795 aa  562  1e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  39.19 
 
 
791 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  39.08 
 
 
829 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  37.9 
 
 
777 aa  552  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  36.93 
 
 
798 aa  548  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.59 
 
 
794 aa  545  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.33 
 
 
794 aa  540  1e-152  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.5 
 
 
815 aa  540  1e-152  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  37.4 
 
 
802 aa  532  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  39.97 
 
 
784 aa  528  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.93 
 
 
783 aa  519  1e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.82 
 
 
806 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  36.16 
 
 
811 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  36.18 
 
 
975 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2626  ATP-dependent protease, putative  37.23 
 
 
803 aa  485  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.39913e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  36.21 
 
 
951 aa  485  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0676  putative ATP-dependent protease LA, putative  37.67 
 
 
810 aa  486  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3315  putative ATP-dependent protease La, putative  36.68 
 
 
806 aa  471  1e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1288  peptidase S16 lon domain protein  36.65 
 
 
811 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  49.5 
 
 
660 aa  455  1e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.67 
 
 
790 aa  455  1e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2798  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
811 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00224654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  31.08 
 
 
774 aa  426  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2053  putative ATP-dependent protease La, putative  36.09 
 
 
817 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0284052  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  32.11 
 
 
797 aa  406  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.7 
 
 
810 aa  382  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.69789e-05  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>