More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0288 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0288  ATPase  100 
 
 
244 aa  502  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  84.02 
 
 
244 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  80.33 
 
 
244 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  78.69 
 
 
244 aa  407  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  78.69 
 
 
244 aa  398  1e-110  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  78.69 
 
 
244 aa  394  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  75.82 
 
 
244 aa  387  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  63.37 
 
 
249 aa  328  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  64.85 
 
 
243 aa  324  9e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  64.85 
 
 
243 aa  323  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  63.37 
 
 
254 aa  318  4e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  64.02 
 
 
243 aa  315  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  9.37515e-06 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 
245 aa  315  6e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  60.67 
 
 
244 aa  303  1e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  61.09 
 
 
247 aa  303  2e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  60 
 
 
310 aa  299  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 
246 aa  300  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  59.41 
 
 
246 aa  297  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  58.61 
 
 
249 aa  297  8e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  58.61 
 
 
249 aa  297  8e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 
251 aa  295  5e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  57.68 
 
 
241 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.92 
 
 
241 aa  290  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.23 
 
 
336 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  58.23 
 
 
333 aa  288  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  55.6 
 
 
241 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  57.38 
 
 
264 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  57.81 
 
 
332 aa  286  3e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  59.58 
 
 
242 aa  286  3e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  59.92 
 
 
283 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  57.38 
 
 
317 aa  285  6e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  57.5 
 
 
314 aa  285  6e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  57.5 
 
 
316 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  57.08 
 
 
247 aa  284  1e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  57.14 
 
 
321 aa  283  2e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.33 
 
 
241 aa  283  2e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  58.65 
 
 
282 aa  282  3e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  57.74 
 
 
240 aa  282  3e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  57.92 
 
 
258 aa  281  5e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  58.23 
 
 
263 aa  281  5e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  57.56 
 
 
246 aa  281  6e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.82009e-07 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  56.67 
 
 
317 aa  281  7e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  55.46 
 
 
240 aa  281  8e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.65 
 
 
268 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
254 aa  280  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.5 
 
 
241 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  56.49 
 
 
243 aa  279  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  56.3 
 
 
239 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  57.26 
 
 
241 aa  279  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  56.68 
 
 
264 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 
241 aa  279  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  57.08 
 
 
241 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  56.49 
 
 
261 aa  279  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
277 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  57.14 
 
 
246 aa  279  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.4361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  54.01 
 
 
271 aa  279  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  57.49 
 
 
251 aa  279  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  57.5 
 
 
258 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  56.96 
 
 
311 aa  279  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  58.16 
 
 
289 aa  278  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  58.16 
 
 
290 aa  278  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 
245 aa  278  6e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  55.92 
 
 
265 aa  278  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  54.01 
 
 
258 aa  278  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  55.51 
 
 
262 aa  276  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  56.72 
 
 
247 aa  277  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  55.04 
 
 
277 aa  276  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  56.85 
 
 
245 aa  276  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  55.19 
 
 
279 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  56.73 
 
 
263 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  57.74 
 
 
289 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  56.33 
 
 
266 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  58.23 
 
 
282 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  56.79 
 
 
268 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  57.32 
 
 
243 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  56.54 
 
 
247 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  57.32 
 
 
243 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  57.32 
 
 
243 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  57.32 
 
 
243 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  53.85 
 
 
256 aa  275  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
243 aa  275  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  56.9 
 
 
244 aa  275  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  54.17 
 
 
252 aa  274  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  57.68 
 
 
243 aa  274  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  8.91993e-05 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  53.97 
 
 
240 aa  273  1e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  57.74 
 
 
243 aa  274  1e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  56.9 
 
 
243 aa  273  1e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  54.73 
 
 
263 aa  273  1e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  56.9 
 
 
270 aa  273  1e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
241 aa  273  1e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  55.28 
 
 
268 aa  274  1e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  56.9 
 
 
243 aa  273  1e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  56.9 
 
 
243 aa  273  1e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
246 aa  273  2e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  56.25 
 
 
241 aa  273  2e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 
258 aa  273  2e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  54.69 
 
 
262 aa  272  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  56.1 
 
 
261 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  57.55 
 
 
255 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  54.39 
 
 
240 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>