More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0247 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
449 aa  919    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  49.55 
 
 
453 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  47.75 
 
 
460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  45.98 
 
 
457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  35.13 
 
 
437 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  35.9 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.17 
 
 
441 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  35.34 
 
 
441 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  34.32 
 
 
417 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  33.62 
 
 
472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  33.24 
 
 
480 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  33.7 
 
 
523 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  31.87 
 
 
473 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  32.4 
 
 
429 aa  179  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  31.87 
 
 
473 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  31.87 
 
 
475 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  34.84 
 
 
741 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  33.74 
 
 
517 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  31.9 
 
 
465 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  30.9 
 
 
479 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  32.96 
 
 
470 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  31.23 
 
 
475 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  31.45 
 
 
503 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  32.39 
 
 
475 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  32.01 
 
 
439 aa  170  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  30.22 
 
 
474 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  31.37 
 
 
468 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  30.51 
 
 
490 aa  168  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  29.95 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  33.86 
 
 
448 aa  167  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  33.8 
 
 
429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  31.09 
 
 
447 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.69 
 
 
503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  29.76 
 
 
472 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  30.42 
 
 
569 aa  159  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  29.13 
 
 
533 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  30.89 
 
 
513 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  34.36 
 
 
440 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  34.36 
 
 
440 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  34.35 
 
 
437 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  30.43 
 
 
464 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  31.58 
 
 
460 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  32.49 
 
 
491 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  28.33 
 
 
471 aa  152  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  30.42 
 
 
438 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  29.81 
 
 
417 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  28.33 
 
 
471 aa  150  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  31.3 
 
 
457 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  30.68 
 
 
462 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  31.3 
 
 
457 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.54 
 
 
312 aa  145  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  29.08 
 
 
470 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  36.1 
 
 
460 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  29.54 
 
 
459 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  27.18 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  29.77 
 
 
491 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  26.98 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  32.11 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  29.3 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  29.43 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  26.92 
 
 
477 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  38.05 
 
 
464 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  31.17 
 
 
457 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  30.05 
 
 
475 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  30.5 
 
 
490 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  29.18 
 
 
491 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  32.22 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  30.23 
 
 
498 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  30.14 
 
 
475 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  29.18 
 
 
468 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  29.72 
 
 
406 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  30.51 
 
 
441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  29.26 
 
 
482 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  33 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  28.61 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  34.89 
 
 
464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  36.11 
 
 
450 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.02 
 
 
420 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  35.71 
 
 
464 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  36.6 
 
 
421 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  29.12 
 
 
464 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  28.33 
 
 
466 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  36.17 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  30.21 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  35.25 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  36.17 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  28.86 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  28.86 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  28.86 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  28.86 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  30.66 
 
 
423 aa  129  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  27.99 
 
 
692 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  29.63 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  30.66 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  29.1 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  29.81 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  32.65 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  30.18 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  29.72 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  28.41 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>