More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0226 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0226  competence protein  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  59.13 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  51.54 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  51.11 
 
 		 269 aa  231  9e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  49.34 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  34.67 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  34.35 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  36.53 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  30.09 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  27.66 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  33.47 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.62 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  36.48 
 
 		 256 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.66 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30.17 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  32.37 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  31.58 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  34.7 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  31.63 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  30.33 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  39.16 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  35.85 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  31 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.96 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.44 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  35.85 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  29.91 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  29.06 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  45.71 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  28 
 
 		 246 aa  91.7  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  34.16 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  27.75 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  27.75 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  32.67 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  34.78 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 213 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.02 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  29.2 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  28.86 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  38.64 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  35.4 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.89 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.7 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  32.91 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  40.52 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  34.36 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  35.71 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  24.17 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  24.11 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  40.19 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  26.03 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  29.6 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  37.09 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.36 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  30.41 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  36.99 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  32.27 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  26.82 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  32.45 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.47 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.47 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  32.6 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  35.91 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  37.88 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  41.44 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  38.3 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  30.89 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  31.62 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>