More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0185 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
98 aa  201  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  92.86 
 
 
98 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  90.82 
 
 
98 aa  189  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  89.8 
 
 
98 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  86.73 
 
 
98 aa  184  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  81.63 
 
 
98 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0293  30S ribosomal protein S19  87.88 
 
 
99 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  71.26 
 
 
89 aa  141  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  71.76 
 
 
93 aa  136  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  64.13 
 
 
94 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
95 aa  134  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  66.28 
 
 
94 aa  133  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  69.05 
 
 
88 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  131  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  69.05 
 
 
93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
95 aa  129  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  65.52 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  60.44 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  65.52 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  66.27 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  68.24 
 
 
93 aa  127  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  63.53 
 
 
89 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
91 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  63.22 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  69.05 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  69.05 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  60.67 
 
 
95 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  64.71 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  66.27 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  65.48 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  63.86 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  61.29 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  65.48 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  64.44 
 
 
90 aa  124  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  66.27 
 
 
93 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
93 aa  125  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  61.9 
 
 
92 aa  124  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 
93 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  62.07 
 
 
88 aa  123  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  64.29 
 
 
93 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  64.29 
 
 
93 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
91 aa  123  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  64.29 
 
 
93 aa  123  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  61.7 
 
 
94 aa  123  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  61.9 
 
 
92 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
90 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  62.79 
 
 
92 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
97 aa  123  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  63.86 
 
 
94 aa  123  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  67.86 
 
 
86 aa  123  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 
92 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  64.71 
 
 
94 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  65.48 
 
 
92 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 
91 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  122  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  63.33 
 
 
92 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  62.07 
 
 
93 aa  122  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  64.44 
 
 
91 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  60.71 
 
 
92 aa  122  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  61.11 
 
 
91 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 
92 aa  122  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  66.27 
 
 
93 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
93 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
94 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  55.56 
 
 
90 aa  121  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
93 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  64.29 
 
 
93 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  58.95 
 
 
96 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  61.9 
 
 
92 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>