More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0180 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  83.73 
 
 		 209 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  80.86 
 
 		 209 aa  354  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  80.86 
 
 		 209 aa  345  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  75.12 
 
 		 209 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  73.68 
 
 		 209 aa  321  4e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2296  50S ribosomal protein L3  68.9 
 
 		 209 aa  298  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600066  hitchhiker  0.00331239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 205 aa  235  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 205 aa  234  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  57.07 
 
 		 205 aa  234  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  56.52 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  55.67 
 
 		 205 aa  228  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 205 aa  227  8e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 205 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 210 aa  211  7e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  51.24 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  50.75 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  46.41 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  46.23 
 
 		 213 aa  195  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  49 
 
 		 218 aa  195  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  47.83 
 
 		 219 aa  194  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1226  50S ribosomal protein L3  48.13 
 
 		 244 aa  191  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0600156  unclonable  0.00000985108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 205 aa  189  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 206 aa  189  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  47.69 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 214 aa  188  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000449005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 216 aa  187  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0192  ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 205 aa  186  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  45.63 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  49.28 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  47.26 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  45.1 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 		 216 aa  184  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 209 aa  184  8e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  47.15 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  44.98 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  42.58 
 
 		 219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000128128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  44.67 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  48.26 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  48.26 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  44.6 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  47 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  43.2 
 
 		 211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  46.11 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  46.11 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  45.54 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  48.47 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  44.28 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0314  50S ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138197  hitchhiker  0.00855725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>