More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0155 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 
380 aa  785    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  80.26 
 
 
379 aa  659    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  78.57 
 
 
379 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  80.26 
 
 
379 aa  656    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  78.42 
 
 
379 aa  627  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  43.35 
 
 
384 aa  344  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  43.09 
 
 
384 aa  340  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  41.95 
 
 
379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  42.71 
 
 
380 aa  338  7e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  41.38 
 
 
380 aa  323  5e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  41.91 
 
 
382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  43.42 
 
 
384 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  43.8 
 
 
382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  41.73 
 
 
382 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  41.73 
 
 
382 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  41.51 
 
 
383 aa  301  9e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  41.58 
 
 
400 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  40.79 
 
 
385 aa  295  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  42.2 
 
 
381 aa  295  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  42.86 
 
 
383 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  39.84 
 
 
384 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  39.84 
 
 
384 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  40.9 
 
 
384 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  39.42 
 
 
386 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  42.03 
 
 
382 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  40.11 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  42.11 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  42.38 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  40.79 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  41.48 
 
 
382 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.04 
 
 
387 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  39.35 
 
 
387 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.06 
 
 
387 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  37.89 
 
 
385 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.37 
 
 
382 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  40.17 
 
 
391 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  39.53 
 
 
385 aa  275  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  40.81 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  42.9 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  40.55 
 
 
387 aa  270  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  37.02 
 
 
363 aa  269  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  38.06 
 
 
382 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.7 
 
 
387 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  40.43 
 
 
388 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  37.57 
 
 
362 aa  260  3e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.12 
 
 
362 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  40.68 
 
 
397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  41.71 
 
 
394 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  37.57 
 
 
362 aa  259  6e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  40.93 
 
 
382 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  37.09 
 
 
384 aa  256  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  37.4 
 
 
395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  39.72 
 
 
412 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  40.11 
 
 
382 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  39.49 
 
 
395 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  36.24 
 
 
383 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  37.04 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.18 
 
 
383 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  34.97 
 
 
415 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  39.47 
 
 
381 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  33.86 
 
 
398 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  34.64 
 
 
406 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  34.64 
 
 
394 aa  229  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  33.33 
 
 
391 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  34.65 
 
 
417 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  38.46 
 
 
390 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  34.99 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  34.69 
 
 
406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  35.05 
 
 
396 aa  226  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  32.9 
 
 
396 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  34.52 
 
 
401 aa  226  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  34.65 
 
 
402 aa  225  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  38.93 
 
 
387 aa  225  9e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  34.46 
 
 
406 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  35.08 
 
 
417 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  32.55 
 
 
391 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 
413 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  34.92 
 
 
360 aa  222  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  35.08 
 
 
406 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  34.29 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.7 
 
 
380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.54 
 
 
381 aa  219  5e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  33.85 
 
 
401 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  34.91 
 
 
421 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  32.9 
 
 
406 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  34.5 
 
 
403 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  32.9 
 
 
396 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  34.72 
 
 
415 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  33.33 
 
 
404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  32.56 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  31.61 
 
 
396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  34.13 
 
 
401 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  34.82 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  32.89 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  32.23 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  32.97 
 
 
385 aa  212  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  32.97 
 
 
385 aa  212  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  34.55 
 
 
401 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  33.68 
 
 
398 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  31.84 
 
 
396 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>