More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0139 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  100 
 
 
294 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  56.23 
 
 
300 aa  314  9e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  51.97 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  47.83 
 
 
311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  53.82 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  54.81 
 
 
292 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  51.67 
 
 
307 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.39 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  38.64 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  39.59 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  38.08 
 
 
310 aa  215  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  38.21 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  40.54 
 
 
302 aa  212  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  37.22 
 
 
285 aa  202  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  35.44 
 
 
310 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  35.1 
 
 
310 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  34.77 
 
 
310 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  37.17 
 
 
293 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  40 
 
 
344 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 
282 aa  187  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  33.45 
 
 
323 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  37.06 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  37.33 
 
 
296 aa  178  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  35.97 
 
 
296 aa  176  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  35.64 
 
 
335 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  33.45 
 
 
302 aa  175  9e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  35.07 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  37.8 
 
 
293 aa  172  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.31 
 
 
345 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.83 
 
 
288 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  30.85 
 
 
299 aa  158  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  32.77 
 
 
292 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.19 
 
 
345 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  27.61 
 
 
316 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.41 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.56 
 
 
316 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.56 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  34.83 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.56 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.56 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.56 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.56 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.25 
 
 
296 aa  133  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  28 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  27.84 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.54 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  25.53 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  31.45 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  33.87 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.49 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  25.53 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.83 
 
 
334 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.83 
 
 
334 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.72 
 
 
296 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  29.2 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  29.46 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  30.43 
 
 
315 aa  126  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.68 
 
 
323 aa  125  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  31.79 
 
 
307 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  28.3 
 
 
318 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.67 
 
 
339 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  31.07 
 
 
307 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  32.95 
 
 
333 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 
296 aa  122  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 
368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  29.13 
 
 
365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  27.9 
 
 
306 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  26.83 
 
 
302 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  35.62 
 
 
469 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  25.81 
 
 
293 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 
346 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 
328 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  31.41 
 
 
312 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  29.2 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  30.34 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 
304 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  29.05 
 
 
276 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 
309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  31.41 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 
311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  27.99 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 
309 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  31.52 
 
 
313 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 
362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 
314 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  30.66 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  30.27 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  26.84 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  27.72 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  31.11 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>