More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0113 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0113  AP endonuclease  100 
 
 		 267 aa  547  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  59.52 
 
 		 258 aa  340  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  62.3 
 
 		 256 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0157  exodeoxyribonuclease III Xth  57.69 
 
 		 258 aa  311  9e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00989742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0161  exodeoxyribonuclease III Xth  55.95 
 
 		 256 aa  308  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.011362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4139  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000428819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0459  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0431  exodeoxyribonuclease III  40.48 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0460  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  35.97 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  34.41 
 
 		 251 aa  159  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  34.94 
 
 		 336 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.21 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  33.85 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  33.2 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  33.2 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  34.63 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  35.48 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  35.29 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  35.29 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  33.73 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  36.72 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  32.55 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  33.87 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  33.59 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  33.73 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  34.9 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  33.47 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  34.12 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  32.95 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  34.12 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  33.6 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  33.2 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  33.73 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  34.36 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  31.25 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  34.13 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  33.85 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  35.66 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 252 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  33.85 
 
 		 249 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  32.41 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 252 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  34.51 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  33.59 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  32.94 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  31.5 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  35.43 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  32.28 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  31.6 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  32.71 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.03 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  32.81 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  32.56 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  33.73 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  34.23 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  33.07 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  33.84 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  34.39 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  34.7 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  35.66 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  30.83 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  34.33 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  32.28 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  32.03 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2715  exonuclease III  32.71 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.946533  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  32.55 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  33.2 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  35.41 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  34.35 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  34.51 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  34.62 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  31.33 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  33.98 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.46 
 
 		 264 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  33.2 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  29.34 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  31.42 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  31.32 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  32.41 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2270  exonuclease III  31.48 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2340  exonuclease III  32.34 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518305  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  32.69 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1976  exonuclease III  32.34 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000370761  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  33.2 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  32.94 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2085  exonuclease III  32.34 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  30.89 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  31.13 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>