More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0090 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0090  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 
113 aa  224  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0087  nitrogen regulatory protein P-II  90.27 
 
 
113 aa  202  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2671  nitrogen regulatory protein P-II  89.38 
 
 
113 aa  196  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000399348  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0095  nitrogen regulatory protein P-II  85.84 
 
 
113 aa  194  2e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1998  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  84.07 
 
 
113 aa  191  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0129  nitrogen regulatory protein P-II  73.45 
 
 
113 aa  176  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0837985  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0108  nitrogen regulatory protein P-II  70.8 
 
 
113 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.834215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 
112 aa  107  8e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.93377e-06  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 
112 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  50 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
136 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.36 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  97.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 
112 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.49 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3159  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
114 aa  96.7  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  49.09 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  4.264e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.74 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  7.71293e-08  hitchhiker  9.23382e-11 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  49.09 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.14961e-05 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0779  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0808  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  46.49 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  42.98 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0555  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  42.11 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  42.98 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  42.11 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  42.11 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0159  nitrogen regulatory protein P-II  42.98 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 
112 aa  94  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  42.11 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  41.23 
 
 
112 aa  94  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68327e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 
112 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>