15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0086 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  100 
 
 
435 aa  864  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0128  hypothetical protein  30.88 
 
 
400 aa  173  4e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0088  hypothetical protein  30.81 
 
 
400 aa  172  9e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.259915  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1523  hypothetical protein  28.83 
 
 
423 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0182  hypothetical protein  29.52 
 
 
385 aa  138  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2790  periplasmic protein  28.81 
 
 
413 aa  112  2e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5699  hypothetical protein  30.03 
 
 
447 aa  97.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3849  hypothetical protein  25.42 
 
 
375 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0636697  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1237  hypothetical protein  26.43 
 
 
484 aa  80.5  6e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78414  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0418  hypothetical protein  28.42 
 
 
551 aa  79.3  1e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.051405 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0097  putative periplasmic protein  34.23 
 
 
311 aa  71.2  3e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0133  hypothetical protein  23.62 
 
 
289 aa  68.9  2e-10  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.581499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  25.42 
 
 
330 aa  52.8  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  25.17 
 
 
332 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2162  curli production assembly/transport component CsgG  23.16 
 
 
327 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>