40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0084 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0084  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  414  1e-115  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  51.96 
 
 
207 aa  206  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  46.63 
 
 
207 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  46.15 
 
 
207 aa  175  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  45.99 
 
 
199 aa  171  7e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0180  conserved hypothetical lipoprotein  32.86 
 
 
209 aa  104  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2792  hypothetical protein  34.15 
 
 
207 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  30.46 
 
 
196 aa  78.2  9e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  29.95 
 
 
196 aa  70.9  1e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  28.93 
 
 
195 aa  66.6  2e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  32.92 
 
 
196 aa  67  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.92 
 
 
204 aa  66.2  3e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  31.84 
 
 
204 aa  65.9  4e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.3 
 
 
204 aa  65.9  4e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0189  hypothetical protein  28.08 
 
 
196 aa  65.9  4e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  32.99 
 
 
195 aa  64.7  1e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.13 
 
 
197 aa  60.8  1e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  31.17 
 
 
205 aa  60.5  2e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  26.73 
 
 
201 aa  58.2  8e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.21511e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.21 
 
 
200 aa  58.2  8e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.91679e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  27.95 
 
 
196 aa  57  2e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.97 
 
 
196 aa  56.2  4e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  26.96 
 
 
201 aa  55.8  4e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.96 
 
 
201 aa  55.1  6e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.52 
 
 
196 aa  55.1  7e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.63 
 
 
197 aa  52.4  5e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  25.25 
 
 
201 aa  51.2  1e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  25.25 
 
 
201 aa  50.1  2e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.38757e-05  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.25 
 
 
201 aa  50.1  2e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.25 
 
 
201 aa  50.1  2e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.25 
 
 
197 aa  50.1  2e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  25.25 
 
 
201 aa  50.1  2e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  25.25 
 
 
201 aa  50.1  2e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.06943e-07  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.25 
 
 
201 aa  50.1  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.77 
 
 
201 aa  49.7  3e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  25.25 
 
 
197 aa  49.7  3e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  25.25 
 
 
201 aa  48.9  5e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2264  hypothetical protein  26.77 
 
 
199 aa  45.1  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680426  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  24.04 
 
 
200 aa  44.7  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1490  hypothetical protein  31.25 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>