40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0082 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  1041  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  36.36 
 
 
457 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  36.75 
 
 
457 aa  214  3e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  33.92 
 
 
448 aa  204  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  34.73 
 
 
453 aa  190  6e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  33.33 
 
 
453 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2794  sporulation domain-containing protein  29.21 
 
 
671 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
487 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  6.98733e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  24.87 
 
 
483 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  25.07 
 
 
465 aa  82  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  27.12 
 
 
559 aa  81.6  3e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  23.95 
 
 
509 aa  80.1  8e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  23.89 
 
 
464 aa  79.7  1e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  23.02 
 
 
468 aa  75.5  2e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  22.25 
 
 
466 aa  75.9  2e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
467 aa  74.7  3e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
467 aa  73.6  9e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.85 
 
 
467 aa  73.6  9e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
467 aa  73.6  9e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  9.96774e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
467 aa  73.2  1e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.89506e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 
466 aa  72.8  2e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.5247e-05  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 
466 aa  72.4  2e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  9.2283e-06  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  22.95 
 
 
452 aa  71.6  3e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
455 aa  70.5  7e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  25.87 
 
 
434 aa  70.5  7e-11  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  23.54 
 
 
453 aa  69.3  1e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  6.025e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
466 aa  69.7  1e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.07995e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 
469 aa  68.9  2e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
455 aa  67  8e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  23.73 
 
 
457 aa  65.9  2e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
455 aa  63.9  6e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 
456 aa  62.8  1e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  23.88 
 
 
459 aa  62.8  1e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  22.74 
 
 
472 aa  60.8  6e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  19.88 
 
 
461 aa  56.2  1e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  6.14425e-07  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  24.86 
 
 
407 aa  55.5  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  25.54 
 
 
407 aa  54.3  5e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  20.6 
 
 
465 aa  52.8  2e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  24.92 
 
 
407 aa  50.4  7e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0631  hypothetical protein  20.89 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.831891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>