More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0076 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  100 
 
 
454 aa  914  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  68.06 
 
 
446 aa  637  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  70.04 
 
 
453 aa  659  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  69.38 
 
 
453 aa  652  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  64.1 
 
 
453 aa  612  1e-174  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  64.75 
 
 
453 aa  604  1e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  63 
 
 
453 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  5.12767e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  39.79 
 
 
469 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  34.73 
 
 
444 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  32.18 
 
 
438 aa  243  4e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  35.86 
 
 
442 aa  237  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  34.87 
 
 
438 aa  235  1e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  31.73 
 
 
438 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.98 
 
 
439 aa  230  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  33.26 
 
 
430 aa  223  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  32.75 
 
 
439 aa  218  3e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  33.71 
 
 
444 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  33.7 
 
 
440 aa  202  1e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  30.72 
 
 
447 aa  201  2e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.2 
 
 
455 aa  198  2e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.48 
 
 
448 aa  197  4e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  32.19 
 
 
454 aa  197  4e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.34 
 
 
450 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  29.4 
 
 
463 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  29.03 
 
 
438 aa  193  6e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.91 
 
 
455 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  32.2 
 
 
450 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.21 
 
 
450 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  31.52 
 
 
450 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  32.48 
 
 
450 aa  189  6e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  31.68 
 
 
450 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.12 
 
 
452 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.25 
 
 
450 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  33.12 
 
 
452 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.99 
 
 
449 aa  186  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  31.68 
 
 
454 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.09 
 
 
456 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.41 
 
 
446 aa  182  8e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  31.68 
 
 
456 aa  182  8e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.63 
 
 
452 aa  182  9e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  30.66 
 
 
466 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  31.21 
 
 
450 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  29.98 
 
 
461 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.29 
 
 
453 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  5.38528e-05  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  31.54 
 
 
452 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  32.09 
 
 
456 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  31.26 
 
 
456 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.13842e-05  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  31.26 
 
 
456 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  9.71838e-05  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  29.45 
 
 
454 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.42 
 
 
450 aa  181  3e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.75 
 
 
456 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.26252e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  29.81 
 
 
453 aa  180  5e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  29.25 
 
 
456 aa  180  5e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.29 
 
 
456 aa  179  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.25455e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.47 
 
 
456 aa  179  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.47 
 
 
456 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.2456e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.63 
 
 
450 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.21 
 
 
456 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.56 
 
 
451 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.47 
 
 
456 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  30.17 
 
 
462 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.83 
 
 
463 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.83 
 
 
463 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.83 
 
 
463 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.83 
 
 
463 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.83 
 
 
463 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.83 
 
 
463 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.21 
 
 
450 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.77 
 
 
461 aa  176  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.71 
 
 
463 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  31.21 
 
 
450 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  31.21 
 
 
450 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.21 
 
 
450 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  31.21 
 
 
450 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  30.44 
 
 
461 aa  176  1e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.29 
 
 
455 aa  174  3e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  28.29 
 
 
454 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  29.31 
 
 
461 aa  173  7e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.42 
 
 
463 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  31 
 
 
450 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.11428e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  31 
 
 
450 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  31 
 
 
450 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.4207e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  31 
 
 
450 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  31 
 
 
450 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  31 
 
 
450 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.11751e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  27.93 
 
 
463 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.13 
 
 
455 aa  170  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.75 
 
 
456 aa  170  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  30.79 
 
 
450 aa  170  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.71457e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  31.81 
 
 
450 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.79 
 
 
441 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  30.57 
 
 
450 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  29.14 
 
 
448 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.4 
 
 
457 aa  167  3e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  28.66 
 
 
446 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  28.93 
 
 
451 aa  166  7e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.41 
 
 
457 aa  166  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  30.41 
 
 
457 aa  166  1e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.41 
 
 
457 aa  166  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  30.83 
 
 
452 aa  164  2e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>