More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0075 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  100 
 
 
358 aa  736  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  80.74 
 
 
357 aa  609  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  77.05 
 
 
357 aa  589  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  75.64 
 
 
357 aa  564  1e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  77.05 
 
 
357 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  72.03 
 
 
357 aa  524  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  69.94 
 
 
357 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.53667e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 
357 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
361 aa  405  1e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 
357 aa  404  1e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
357 aa  405  1e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.75 
 
 
357 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 
356 aa  399  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
355 aa  392  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  52.23 
 
 
359 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  53.09 
 
 
357 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  51.26 
 
 
359 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
358 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 
358 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 
358 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 
363 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
360 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 
355 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 
358 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  52.26 
 
 
357 aa  381  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.16881e-11  hitchhiker  3.05481e-10 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 
355 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  53.67 
 
 
355 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 
356 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 
358 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 
357 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
355 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.00734e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
359 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 
359 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 
359 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  56.46 
 
 
357 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  51.97 
 
 
356 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  53.91 
 
 
355 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
355 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.28855e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
361 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 
362 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
358 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 
358 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  2.10571e-09  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 
358 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.02201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  53.09 
 
 
355 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
358 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38678e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 
358 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.42042e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 
361 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
370 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
358 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.04378e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.78 
 
 
356 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 
354 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 
355 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.69919e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
370 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 
355 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
358 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  3.28302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
358 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.02063e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 
355 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.06535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
360 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.61971e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
358 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.01474e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 
358 aa  368  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.76457e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  48.89 
 
 
370 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
354 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 
360 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.28118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 
372 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 
357 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 
355 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  7.29315e-09  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 
355 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.88952e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
356 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.57905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
353 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 
360 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  7.99175e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 
356 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 
368 aa  363  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  52.22 
 
 
364 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  4.54931e-05  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
360 aa  363  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
359 aa  363  3e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 
355 aa  363  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.63816e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
367 aa  362  5e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  57.01 
 
 
351 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 
362 aa  361  1e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 
355 aa  360  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 
360 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 
355 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  5.09235e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  57.01 
 
 
351 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
366 aa  360  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
356 aa  360  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  9.63425e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 
356 aa  359  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
369 aa  359  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1020  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 
355 aa  359  4e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1210  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 
355 aa  359  5e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
361 aa  358  9e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 
351 aa  357  2e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 
357 aa  356  3e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
362 aa  356  4e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.01734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 
359 aa  356  4e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 
359 aa  355  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  48.62 
 
 
357 aa  355  7e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
355 aa  355  7e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 
377 aa  355  7e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 
354 aa  355  8e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 
358 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.77535e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>