More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0064 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  100 
 
 
397 aa  813  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  73.99 
 
 
397 aa  614  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  70.2 
 
 
397 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  69.95 
 
 
397 aa  583  1e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  39.39 
 
 
406 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.83 
 
 
397 aa  283  5e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.95 
 
 
416 aa  279  8e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 
396 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 
396 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.46 
 
 
404 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 
463 aa  274  2e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
403 aa  272  9e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 
402 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 
402 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 
383 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 
438 aa  269  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
438 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  36.48 
 
 
417 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.61 
 
 
446 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 
394 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  36.83 
 
 
393 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 
400 aa  266  5e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 
394 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.35 
 
 
420 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  36.29 
 
 
439 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  36.99 
 
 
393 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 
400 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  35.81 
 
 
393 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
398 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
450 aa  259  5e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
414 aa  259  5e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  37.3 
 
 
406 aa  259  5e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  36.57 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.32 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  35.81 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  36.57 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.32 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  36.57 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  36.57 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  36.57 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  36.57 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
437 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
406 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 
441 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.88 
 
 
430 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
393 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.67 
 
 
433 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 
396 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
416 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  36.16 
 
 
446 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 
395 aa  255  1e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
398 aa  255  1e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
405 aa  254  2e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 
394 aa  254  2e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
395 aa  254  2e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 
426 aa  254  2e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
407 aa  254  2e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 
436 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.84 
 
 
436 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  35.53 
 
 
395 aa  253  4e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  35.18 
 
 
433 aa  253  4e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
426 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
395 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 
432 aa  251  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  38.64 
 
 
406 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  36.19 
 
 
400 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 
377 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 
435 aa  250  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  34.86 
 
 
398 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
395 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  39.33 
 
 
402 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  37.06 
 
 
397 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
393 aa  249  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  38.2 
 
 
498 aa  249  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 
441 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
398 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
395 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 
425 aa  246  5e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
397 aa  246  5e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  4.0274e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 
395 aa  246  6e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 
396 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
398 aa  245  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.5 
 
 
397 aa  245  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 
398 aa  244  2e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
399 aa  244  2e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 
386 aa  243  4e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.48876e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 
611 aa  243  4e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
426 aa  243  4e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  33.59 
 
 
440 aa  243  4e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  36.07 
 
 
398 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
401 aa  242  9e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
388 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 
396 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
395 aa  240  3e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  33.58 
 
 
414 aa  240  3e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
397 aa  240  3e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
340 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 
398 aa  239  7e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>