More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0062 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
145 aa  304  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  62.68 
 
 
148 aa  203  6e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  62.68 
 
 
151 aa  196  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  62.24 
 
 
144 aa  193  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  59.86 
 
 
144 aa  189  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 
150 aa  140  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  55.3 
 
 
139 aa  140  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.45 
 
 
146 aa  139  1e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  51.06 
 
 
150 aa  137  4e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.91 
 
 
143 aa  132  1e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.76 
 
 
154 aa  131  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.89 
 
 
140 aa  130  4e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  50.76 
 
 
142 aa  125  2e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.6 
 
 
138 aa  124  4e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  45.65 
 
 
142 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  48.85 
 
 
144 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 
144 aa  120  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  45.65 
 
 
145 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  44.76 
 
 
143 aa  117  4e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.56 
 
 
152 aa  117  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  45.93 
 
 
142 aa  117  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 
142 aa  115  2e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.68 
 
 
137 aa  115  2e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  46.56 
 
 
143 aa  114  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 
142 aa  113  8e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.06 
 
 
143 aa  113  1e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  1.14358e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.89 
 
 
144 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
142 aa  108  2e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  45.65 
 
 
143 aa  108  2e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  42.25 
 
 
140 aa  108  2e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 
138 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
143 aa  107  7e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.62 
 
 
164 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.19 
 
 
299 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  41.09 
 
 
164 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.57 
 
 
139 aa  103  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
299 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
138 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  44.36 
 
 
139 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
140 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
258 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  40.43 
 
 
164 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.27 
 
 
138 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
143 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
258 aa  100  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  42.45 
 
 
148 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.08591e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
141 aa  99  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.64011e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
140 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.71 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  41.86 
 
 
164 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  38.69 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.36 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
270 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.59 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.96 
 
 
138 aa  94.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  40.74 
 
 
134 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  36.13 
 
 
188 aa  94  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.13813e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  40.74 
 
 
134 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  40.74 
 
 
134 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  41.48 
 
 
134 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  41.48 
 
 
134 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  8.15636e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  41.48 
 
 
134 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.55 
 
 
270 aa  93.6  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  40.74 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.68 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  37.93 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.06 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  40.31 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  40 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.68 
 
 
453 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  40.8 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  39.55 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.58516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
275 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  41.91 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  36.62 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  42.64 
 
 
254 aa  90.5  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.86 
 
 
175 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.8 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
255 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
276 aa  90.5  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
127 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  33.79 
 
 
270 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
254 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  39.69 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 
138 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  36.11 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 
146 aa  89  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 
175 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  37.76 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  37.76 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.72 
 
 
135 aa  88.6  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>