More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0060 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  606  1e-172  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  72.6 
 
 
293 aa  454  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  72.95 
 
 
294 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  69.28 
 
 
297 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.95859e-06  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  69.18 
 
 
305 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  67.58 
 
 
294 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  55.67 
 
 
295 aa  354  8e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.92 
 
 
290 aa  303  3e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  49.12 
 
 
292 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  48.61 
 
 
291 aa  290  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  45.26 
 
 
295 aa  274  1e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 
293 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1077  hypothetical protein  62.41 
 
 
146 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.158913  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
294 aa  109  7e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  30.71 
 
 
321 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.96465e-06 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
298 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  27.94 
 
 
343 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  1.04302e-07  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.49 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  27.64 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  26.02 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.89 
 
 
320 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  27.73 
 
 
341 aa  93.6  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  26.09 
 
 
340 aa  93.2  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  27.05 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.02 
 
 
329 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.87 
 
 
328 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  28.66 
 
 
342 aa  90.1  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  29.92 
 
 
346 aa  90.1  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  26.64 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  24.37 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  28 
 
 
391 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  31.84 
 
 
306 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  26.41 
 
 
327 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.67 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.34 
 
 
327 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
306 aa  85.5  1e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
309 aa  85.5  1e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
304 aa  84.7  2e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.39 
 
 
286 aa  83.6  3e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
308 aa  83.2  4e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  28.25 
 
 
315 aa  83.2  5e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
304 aa  82.8  6e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  29.37 
 
 
332 aa  82.8  6e-15  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  1.80564e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  25.67 
 
 
291 aa  82.4  9e-15  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  23.68 
 
 
339 aa  81.6  1e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.44 
 
 
295 aa  81.3  2e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
330 aa  81.3  2e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
320 aa  80.9  3e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
306 aa  80.1  4e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
328 aa  79.7  5e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  27.97 
 
 
328 aa  79.7  5e-14  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  23.5 
 
 
302 aa  79.7  6e-14  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 
298 aa  79  8e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
301 aa  78.6  1e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  6.31185e-07 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  27.78 
 
 
328 aa  77.8  2e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
308 aa  77.8  2e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
307 aa  77.8  2e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.74 
 
 
332 aa  77.4  3e-13  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  28.41 
 
 
328 aa  77  4e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  26.65 
 
 
381 aa  76.6  5e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.79 
 
 
320 aa  76.6  5e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
295 aa  76.3  5e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.42 
 
 
216 aa  76.3  6e-13  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  27.49 
 
 
292 aa  75.9  8e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26 
 
 
297 aa  75.5  9e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.12867e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
295 aa  75.1  1e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.79 
 
 
320 aa  75.1  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
335 aa  75.1  1e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  27.54 
 
 
290 aa  74.7  2e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  26.07 
 
 
320 aa  74.7  2e-12  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3136  NmrA family protein  31.56 
 
 
337 aa  74.7  2e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
305 aa  74.7  2e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  30.33 
 
 
284 aa  74.3  2e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
321 aa  74.7  2e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
381 aa  73.6  3e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  23.91 
 
 
323 aa  73.6  3e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  2.16715e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  23.91 
 
 
323 aa  73.6  3e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
353 aa  73.9  3e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
326 aa  74.3  3e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.37 
 
 
330 aa  73.9  3e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
321 aa  73.2  4e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  27.54 
 
 
290 aa  73.6  4e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  30.96 
 
 
295 aa  73.6  4e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  28.51 
 
 
287 aa  73.6  4e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
328 aa  73.2  5e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
344 aa  73.2  5e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.23 
 
 
326 aa  72.8  6e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  27.82 
 
 
340 aa  72.4  8e-12  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  27.52 
 
 
328 aa  72.4  8e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
326 aa  72.4  9e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  27.16 
 
 
344 aa  72.4  9e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.59 
 
 
320 aa  72  1e-11  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0152  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  25.94 
 
 
335 aa  71.6  1e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  27.72 
 
 
287 aa  72  1e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  26.89 
 
 
287 aa  72  1e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>