More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0057 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  100 
 
 
470 aa  954  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  49.14 
 
 
443 aa  395  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  48.89 
 
 
441 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  48.89 
 
 
441 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  44.36 
 
 
457 aa  312  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 
444 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 
429 aa  120  5e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.27 
 
 
463 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.32 
 
 
497 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 
419 aa  97.8  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  27.12 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 
419 aa  93.2  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 
427 aa  93.2  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 
448 aa  91.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  1.65447e-09  hitchhiker  5.61163e-13 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.55286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.88 
 
 
522 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.27 
 
 
485 aa  90.5  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 
420 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 
535 aa  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.12 
 
 
464 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.49 
 
 
497 aa  88.2  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.31 
 
 
435 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.41 
 
 
487 aa  86.3  1e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 
471 aa  85.9  1e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 
738 aa  85.5  2e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.73 
 
 
460 aa  85.9  2e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.71 
 
 
449 aa  85.1  3e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 
424 aa  84.7  3e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 
419 aa  83.6  6e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  26.78 
 
 
471 aa  83.6  7e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 
496 aa  81.6  3e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.74 
 
 
494 aa  80.9  4e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 
441 aa  81.3  4e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 
460 aa  80.5  5e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  27.75 
 
 
462 aa  80.5  6e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 
417 aa  80.1  8e-14  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  4.50472e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  20.47 
 
 
440 aa  79.7  1e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 
425 aa  79.7  1e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  24.12 
 
 
461 aa  79  2e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 
423 aa  78.6  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.88 
 
 
490 aa  78.6  3e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 
1496 aa  78.2  3e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.52 
 
 
455 aa  78.2  3e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  25.4 
 
 
469 aa  77.8  4e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  25.48 
 
 
472 aa  77.8  4e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  24.64 
 
 
594 aa  77.8  4e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.66 
 
 
470 aa  77.8  4e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.95 
 
 
463 aa  77.8  4e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.46 
 
 
464 aa  77.8  4e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.17 
 
 
469 aa  77.4  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.23 
 
 
497 aa  77.4  5e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.17 
 
 
469 aa  77  7e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 
476 aa  76.6  8e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 
476 aa  76.6  8e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 
433 aa  76.3  1e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 
421 aa  76.3  1e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25 
 
 
442 aa  76.3  1e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.24 
 
 
576 aa  76.6  1e-12  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  22 
 
 
445 aa  74.7  3e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 
433 aa  74.3  5e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  28.13 
 
 
437 aa  73.9  5e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 
421 aa  73.9  6e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.22 
 
 
489 aa  73.2  9e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.94 
 
 
469 aa  73.2  9e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 
471 aa  72.8  1e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  25.35 
 
 
445 aa  72.8  1e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 
426 aa  72.4  2e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 
447 aa  72.4  2e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.53 
 
 
471 aa  72.4  2e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 
1470 aa  71.6  3e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 
488 aa  71.2  3e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 
488 aa  71.6  3e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 
441 aa  71.2  4e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  6.26538e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  24.54 
 
 
493 aa  71.2  4e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
497 aa  71.2  4e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.06 
 
 
452 aa  71.2  4e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  8.26676e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  25.87 
 
 
456 aa  70.9  5e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  25 
 
 
467 aa  70.9  5e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 
525 aa  70.5  6e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 
438 aa  70.5  6e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  25.38 
 
 
443 aa  70.1  7e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 
439 aa  70.1  8e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 
431 aa  70.1  8e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 
472 aa  69.7  1e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 
488 aa  69.3  1e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.06 
 
 
469 aa  69.3  1e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
424 aa  69.3  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 
463 aa  68.2  3e-10  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.37 
 
 
455 aa  68.2  3e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 
443 aa  68.2  3e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  3.99706e-08  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.09 
 
 
480 aa  67.8  4e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.03 
 
 
449 aa  67.4  5e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 
483 aa  67.4  5e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  22.69 
 
 
456 aa  67.4  6e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  22.69 
 
 
452 aa  67.4  6e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  24.69 
 
 
441 aa  67.4  6e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.83 
 
 
480 aa  67  7e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  26.26 
 
 
528 aa  67  7e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>