More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0056 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  100 
 
 
157 aa  329  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  45.67 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  46.88 
 
 
157 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  46.56 
 
 
157 aa  107  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.72 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  36.76 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.71 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.46 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.97 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  38.51 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  38.51 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  38.51 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.51 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  32.59 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.47 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.29 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.09 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  29.86 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  29.86 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  31.21 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  33.56 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.25 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  32.64 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.87 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  33.08 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.09 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.66 
 
 
286 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.95 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.95 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  27.86 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  34.03 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  33.33 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  51.67 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  32.19 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  40.62 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.41 
 
 
149 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  35.46 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.33 
 
 
180 aa  60.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  33.81 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  32.17 
 
 
212 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  41.79 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  30.4 
 
 
284 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  30.86 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 
137 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  40 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  32.86 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  50.94 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  39.68 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  42.03 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.26 
 
 
304 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  32.59 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  30.77 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  39.19 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.14 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  46.43 
 
 
217 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.27 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.68 
 
 
627 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  26.67 
 
 
171 aa  57.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  45.76 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  28.26 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  32.03 
 
 
134 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  26.35 
 
 
151 aa  57.4  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.33 
 
 
320 aa  57.4  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.08 
 
 
138 aa  57.4  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  41.27 
 
 
290 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  33.09 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  43.48 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  32.14 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  32.61 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
297 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  29.63 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  29.93 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  36.08 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.93 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  44.78 
 
 
297 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  26.81 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  41.27 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  30.07 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  27.08 
 
 
276 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  27.92 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.93 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  44.29 
 
 
314 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  30.66 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.56 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  23.74 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  39.06 
 
 
207 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  40.91 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  43.86 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.56 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  45.9 
 
 
300 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>