More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0053 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  100 
 
 
431 aa  856  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  73.52 
 
 
433 aa  640  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  67.08 
 
 
429 aa  540  1e-152  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  56.74 
 
 
436 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  55.79 
 
 
440 aa  493  1e-138  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  59.29 
 
 
442 aa  491  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  48.47 
 
 
430 aa  407  1e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 
412 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  41.41 
 
 
418 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  37.97 
 
 
428 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.06756e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  40.53 
 
 
474 aa  252  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 
421 aa  249  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  38.44 
 
 
446 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  37.04 
 
 
474 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
432 aa  246  7e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  37.75 
 
 
412 aa  244  2e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 
419 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  38.12 
 
 
413 aa  241  3e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 
378 aa  239  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  36.52 
 
 
447 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 
440 aa  236  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  37.53 
 
 
441 aa  235  1e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 
431 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  35.5 
 
 
424 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 
408 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  37.75 
 
 
413 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  33.58 
 
 
418 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
450 aa  223  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 
418 aa  221  2e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
433 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
461 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 
409 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
453 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  3.22743e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  37.04 
 
 
414 aa  219  8e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 
404 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
417 aa  216  6e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  35.1 
 
 
413 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  34.15 
 
 
426 aa  215  1e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 
417 aa  215  1e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
418 aa  214  2e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 
423 aa  214  3e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
415 aa  213  5e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  36.93 
 
 
450 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  34.49 
 
 
413 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  34.49 
 
 
413 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  34.24 
 
 
413 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
476 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  33.42 
 
 
426 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 
435 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
401 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  29.57 
 
 
413 aa  203  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
442 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 
424 aa  202  1e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  35.36 
 
 
405 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
419 aa  201  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
456 aa  199  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  31.23 
 
 
435 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  36.55 
 
 
441 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  35 
 
 
416 aa  199  8e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
446 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  33.33 
 
 
457 aa  199  1e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
403 aa  198  2e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 
402 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  34.27 
 
 
405 aa  197  4e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  32.98 
 
 
410 aa  196  8e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.09 
 
 
446 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  37.92 
 
 
452 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
441 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  33.25 
 
 
412 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  34.15 
 
 
418 aa  193  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  34.72 
 
 
426 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  32.07 
 
 
426 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  32.13 
 
 
410 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
413 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  34.31 
 
 
429 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  32.36 
 
 
423 aa  191  3e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
428 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  34.64 
 
 
450 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 
432 aa  189  6e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  31.74 
 
 
426 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  35.47 
 
 
416 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  33 
 
 
441 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  33.41 
 
 
412 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
431 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
410 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 
404 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  29.24 
 
 
403 aa  184  2e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 
436 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 
405 aa  183  4e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
425 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 
421 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
417 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  34.62 
 
 
412 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  29.07 
 
 
431 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
414 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  41.34 
 
 
491 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  34.1 
 
 
424 aa  179  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
419 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
453 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  31.78 
 
 
414 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>