21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0046 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  266  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  48.03 
 
 
129 aa  127  4e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  46.88 
 
 
126 aa  120  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  47.9 
 
 
121 aa  120  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  46.77 
 
 
126 aa  119  2e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  54.26 
 
 
131 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  39.17 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  34.45 
 
 
134 aa  82  2e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  41.18 
 
 
139 aa  79.7  1e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  32.86 
 
 
147 aa  78.6  3e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  35.71 
 
 
126 aa  76.6  1e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  34.62 
 
 
137 aa  76.6  1e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  41.18 
 
 
126 aa  74.7  4e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  30.23 
 
 
129 aa  74.3  5e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  32.54 
 
 
128 aa  72.8  1e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  31.15 
 
 
126 aa  70.9  7e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  37.65 
 
 
126 aa  69.3  2e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  32.53 
 
 
114 aa  51.2  5e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  28.97 
 
 
188 aa  48.1  4e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  24.17 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>