34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0044 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  100 
 
 
331 aa  678    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  71 
 
 
331 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  67.37 
 
 
331 aa  480  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  66.47 
 
 
331 aa  475  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  65.86 
 
 
331 aa  461  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  63.03 
 
 
331 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  63.03 
 
 
332 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  50.3 
 
 
333 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  51.99 
 
 
335 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  54.31 
 
 
330 aa  349  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  53.11 
 
 
332 aa  346  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  52.47 
 
 
330 aa  342  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  52.01 
 
 
334 aa  338  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  52.61 
 
 
337 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  50 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  48.62 
 
 
334 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  47.75 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  33.91 
 
 
255 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  33.09 
 
 
233 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  30.82 
 
 
248 aa  106  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  31.11 
 
 
244 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  33.84 
 
 
249 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  26.05 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  26.05 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  27.2 
 
 
271 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  26.52 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  34.29 
 
 
257 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  28.19 
 
 
262 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  23.16 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.3 
 
 
234 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  26.22 
 
 
255 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  28.31 
 
 
289 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.13 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.11 
 
 
234 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>