15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0043 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  302  1e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0702  hypothetical protein  54.11 
 
 
148 aa  162  1e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  43.24 
 
 
148 aa  130  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0135  hypothetical protein  41.91 
 
 
148 aa  114  4e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000621154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  37.01 
 
 
156 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  35.37 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  76.6  9e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  24.84 
 
 
189 aa  58.5  3e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  57  9e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  30.33 
 
 
175 aa  53.9  6e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  24.68 
 
 
163 aa  54.3  6e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  26.97 
 
 
173 aa  52.4  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.34264e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  24.18 
 
 
172 aa  51.6  4e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  27.87 
 
 
179 aa  50.8  6e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  23.72 
 
 
181 aa  50.8  6e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>