115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0023 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3803  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.43 
 
 
595 aa  697  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0268368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.41 
 
 
622 aa  847  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0031  phosphoenolpyruvate carboxykinase  87.06 
 
 
621 aa  1132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3462  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.26 
 
 
616 aa  960  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00146202  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0033  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.39 
 
 
619 aa  1069  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00652728  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0052  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.52 
 
 
622 aa  1073  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0050  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.04 
 
 
617 aa  1098  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.91 
 
 
596 aa  672  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.55 
 
 
647 aa  956  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1092  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.46 
 
 
615 aa  879  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.28153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3060  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.97 
 
 
611 aa  913  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0814  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.92 
 
 
616 aa  665  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0304  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.66 
 
 
618 aa  858  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.39 
 
 
608 aa  791  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0030  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.43 
 
 
618 aa  864  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2846  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.22 
 
 
619 aa  936  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0833  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.89 
 
 
607 aa  729  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.961355  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.72 
 
 
612 aa  731  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0429  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.11 
 
 
609 aa  940  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0114  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.92 
 
 
621 aa  800  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4179  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.22 
 
 
621 aa  840  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5861  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.38 
 
 
621 aa  833  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0061457  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3945  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.07 
 
 
624 aa  832  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.83 
 
 
621 aa  804  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.401418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4337  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.88 
 
 
621 aa  835  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171567  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0718  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.72 
 
 
608 aa  846  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3817  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.91 
 
 
596 aa  673  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.799264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0212  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.16 
 
 
597 aa  758  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0812521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0097  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.21 
 
 
623 aa  794  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0386  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  58.96 
 
 
619 aa  700  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8530  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  57.92 
 
 
614 aa  723  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741618  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4211  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  63.79 
 
 
614 aa  784  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16117  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4876  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  60.75 
 
 
604 aa  743  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2799  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  69.02 
 
 
616 aa  912  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0731  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  58.35 
 
 
611 aa  702  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2479  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  59.63 
 
 
597 aa  707  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.215275  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0476  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  60.21 
 
 
608 aa  747  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540032  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0372  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  58.43 
 
 
614 aa  713  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121047  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3094  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.64 
 
 
598 aa  748  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.426752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4143  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  60.24 
 
 
605 aa  750  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06760  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  56.42 
 
 
646 aa  692  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2819  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  62.56 
 
 
604 aa  759  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  2.09733e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4475  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  59.76 
 
 
608 aa  738  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.475526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.69 
 
 
588 aa  691  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3601  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.26 
 
 
655 aa  654  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.03 
 
 
620 aa  828  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03380  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.11 
 
 
614 aa  637  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3416  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.25 
 
 
622 aa  844  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0749  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.55 
 
 
647 aa  957  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6994  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.38 
 
 
603 aa  695  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0693  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.68 
 
 
598 aa  646  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.64 
 
 
617 aa  756  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39080  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.67 
 
 
608 aa  716  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.377396  normal  0.557231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5314  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.58 
 
 
647 aa  697  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0621  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  69.18 
 
 
632 aa  912  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.655459  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3537  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.68 
 
 
625 aa  699  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310577  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0051  phosphoenolpyruvate carboxykinase  83.33 
 
 
621 aa  1104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.91 
 
 
596 aa  671  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3897  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.24 
 
 
609 aa  761  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0160  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.31 
 
 
622 aa  815  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000637249  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4422  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.32 
 
 
618 aa  863  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0707425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3577  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.01 
 
 
618 aa  853  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3922  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.55 
 
 
621 aa  835  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0176  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.07 
 
 
609 aa  691  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.71 
 
 
621 aa  834  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309168  normal  0.0994612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0667  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.87 
 
 
611 aa  673  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.55 
 
 
621 aa  835  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0901  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.5 
 
 
616 aa  868  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2808  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.19 
 
 
621 aa  831  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0495385  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3419  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.95 
 
 
620 aa  841  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2638  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.17 
 
 
617 aa  965  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.94383e-07  normal  0.814307 
 
 
-
 
NC_002620  TC0083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.23 
 
 
599 aa  693  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3385  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.83 
 
 
618 aa  969  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0017  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.1 
 
 
622 aa  836  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.982063  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.19 
 
 
621 aa  830  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0665  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.71 
 
 
614 aa  872  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.01 
 
 
604 aa  778  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3420  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.13 
 
 
618 aa  849  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1574  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.19 
 
 
621 aa  830  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347763  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1511  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.55 
 
 
621 aa  832  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0023  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
621 aa  1296  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.162015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2012  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.84 
 
 
630 aa  1073  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0537  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.64 
 
 
584 aa  837  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.584132  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0190  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.66 
 
 
614 aa  686  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.04 
 
 
606 aa  681  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.116836  normal  0.471876 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1475  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.19 
 
 
621 aa  830  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.07 
 
 
609 aa  691  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0533  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.19 
 
 
616 aa  830  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0451  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.47 
 
 
609 aa  695  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.09 
 
 
621 aa  815  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0861  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.69 
 
 
612 aa  721  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.473448  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1446  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.19 
 
 
621 aa  830  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0870  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.75 
 
 
617 aa  978  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00431316  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5171  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.83 
 
 
606 aa  741  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0325265  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2496  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.71 
 
 
619 aa  940  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.754041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.08 
 
 
605 aa  790  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00158332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0620  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.19 
 
 
621 aa  830  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.755794  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3705  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.4 
 
 
625 aa  823  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0185  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.07 
 
 
609 aa  691  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1673  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.79 
 
 
592 aa  757  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>