More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0016 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  81.79 
 
 
380 aa  635  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
380 aa  781  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  83.11 
 
 
380 aa  641  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  82.85 
 
 
380 aa  646  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  82.06 
 
 
380 aa  630  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  74.14 
 
 
379 aa  567  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  72.82 
 
 
379 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  42.47 
 
 
452 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.95 
 
 
446 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  42.09 
 
 
446 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.36 
 
 
446 aa  285  1e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.13 
 
 
468 aa  283  3e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  39.86 
 
 
455 aa  282  6e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  40.3 
 
 
457 aa  282  9e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  40.84 
 
 
405 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  40.29 
 
 
406 aa  277  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  40.84 
 
 
405 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  6.08264e-05  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  40.39 
 
 
407 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  40.35 
 
 
418 aa  275  1e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  40.93 
 
 
449 aa  273  4e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  39.22 
 
 
405 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  39.3 
 
 
406 aa  269  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  38.13 
 
 
406 aa  263  5e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  37.63 
 
 
406 aa  259  5e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  39.95 
 
 
445 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  38.54 
 
 
443 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  38.54 
 
 
443 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  39.29 
 
 
462 aa  248  9e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  38.87 
 
 
394 aa  243  4e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  38.87 
 
 
394 aa  243  4e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  37.05 
 
 
421 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  38.08 
 
 
463 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  39.9 
 
 
394 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  38.65 
 
 
402 aa  234  2e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  38.82 
 
 
405 aa  233  4e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  36.22 
 
 
400 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  38.6 
 
 
394 aa  229  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  36.36 
 
 
403 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  36.48 
 
 
408 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  36.15 
 
 
400 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  36.27 
 
 
393 aa  221  1e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  37.95 
 
 
399 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  35.95 
 
 
400 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  34.82 
 
 
397 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  34.96 
 
 
397 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  34.89 
 
 
397 aa  214  2e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  36.29 
 
 
413 aa  213  5e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  33.96 
 
 
401 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  34.63 
 
 
330 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 
378 aa  147  2e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.24296e-05 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  32.2 
 
 
365 aa  127  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  32.99 
 
 
375 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  30.69 
 
 
387 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 
403 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  33.33 
 
 
384 aa  111  2e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 
390 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 
390 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30.51 
 
 
379 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  29.16 
 
 
387 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  30 
 
 
390 aa  106  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 
423 aa  106  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.96 
 
 
382 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
390 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 
368 aa  103  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 
391 aa  103  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  29.5 
 
 
341 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.98 
 
 
398 aa  99.8  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 
370 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 
425 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 
382 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 
376 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  28.93 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 
363 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  26.03 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.7 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 
382 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.45 
 
 
384 aa  92.8  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 
360 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  24 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  7.05466e-05 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.34 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.86 
 
 
396 aa  90.1  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 
453 aa  89  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  29.1 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  29.23 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 
406 aa  87  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.99674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.93 
 
 
435 aa  86.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>