More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0014 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  100 
 
 
564 aa  1124    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  49.72 
 
 
585 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  47.7 
 
 
563 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  46.03 
 
 
572 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  44.69 
 
 
565 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  45.54 
 
 
556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  42.1 
 
 
582 aa  423  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  39.23 
 
 
553 aa  350  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  35.75 
 
 
550 aa  333  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 
550 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
557 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  34.8 
 
 
555 aa  296  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  33.52 
 
 
566 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  32.74 
 
 
569 aa  285  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  31.36 
 
 
545 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  31.63 
 
 
540 aa  268  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  39.6 
 
 
448 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  39.6 
 
 
448 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 
453 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  38.23 
 
 
449 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.08 
 
 
440 aa  226  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  40.85 
 
 
463 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  38.29 
 
 
449 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  33.66 
 
 
434 aa  224  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
438 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
438 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  34.89 
 
 
842 aa  224  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  42.49 
 
 
433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  41.38 
 
 
436 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  41.38 
 
 
436 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  39.11 
 
 
437 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  40.13 
 
 
445 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  35.12 
 
 
538 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  40.11 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  40.13 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  37.64 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  39.75 
 
 
439 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  39.21 
 
 
440 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
440 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  32.41 
 
 
552 aa  219  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  36.05 
 
 
556 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  38.63 
 
 
445 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  38.96 
 
 
440 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  38.96 
 
 
440 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  38.66 
 
 
451 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  39.57 
 
 
446 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  38.96 
 
 
440 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.14 
 
 
423 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  40.57 
 
 
446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  37.93 
 
 
515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
444 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  41.85 
 
 
443 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.2 
 
 
452 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  40.94 
 
 
463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  34.38 
 
 
471 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  39.45 
 
 
458 aa  216  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  38.86 
 
 
462 aa  216  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  38.38 
 
 
457 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  40.22 
 
 
457 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  38.65 
 
 
444 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  38.2 
 
 
511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 
458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  34.9 
 
 
418 aa  215  1.9999999999999998e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  38.25 
 
 
444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  37.4 
 
 
515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  38.2 
 
 
513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  38.53 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  38.26 
 
 
524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  38.26 
 
 
524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  38.26 
 
 
524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  38.26 
 
 
530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  38.26 
 
 
524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  38.26 
 
 
530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 
515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 
515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 
444 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  38.26 
 
 
524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 
515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  34.92 
 
 
477 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  36.46 
 
 
530 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  37.42 
 
 
444 aa  213  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  37.78 
 
 
443 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  38.53 
 
 
456 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  37.99 
 
 
521 aa  213  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  40.31 
 
 
426 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  37.82 
 
 
456 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  35.93 
 
 
444 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  34.57 
 
 
507 aa  211  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  32.75 
 
 
544 aa  211  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  34.14 
 
 
480 aa  211  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 
482 aa  211  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  38.34 
 
 
482 aa  211  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  39.45 
 
 
452 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.22 
 
 
443 aa  210  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 
445 aa  210  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 
455 aa  210  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  38.28 
 
 
526 aa  210  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  39.2 
 
 
437 aa  210  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>