More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0012 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  85.81 
 
 
565 aa  980  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  100 
 
 
570 aa  1167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  3.76513e-06  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  84.75 
 
 
566 aa  939  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  80.56 
 
 
551 aa  909  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  2.01428e-07  unclonable  1.66802e-06 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  86.49 
 
 
562 aa  985  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  82.35 
 
 
570 aa  919  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  83.36 
 
 
568 aa  954  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  40.4 
 
 
604 aa  407  1e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  37.93 
 
 
520 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  37.18 
 
 
516 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  39.03 
 
 
504 aa  369  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  37.87 
 
 
535 aa  362  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  37.02 
 
 
520 aa  354  3e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  37.32 
 
 
516 aa  346  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  35.55 
 
 
543 aa  333  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  34.11 
 
 
516 aa  326  6e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  36.79 
 
 
503 aa  324  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.77215e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  41.46 
 
 
516 aa  318  1e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  35.6 
 
 
543 aa  314  3e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  38.82 
 
 
530 aa  310  6e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  36.26 
 
 
496 aa  307  4e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  36.06 
 
 
496 aa  304  3e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  35.48 
 
 
503 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.58312e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  35.78 
 
 
531 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  31.16 
 
 
512 aa  298  1e-79  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  36.83 
 
 
517 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  33.27 
 
 
515 aa  297  4e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  36.45 
 
 
503 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  33.01 
 
 
496 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  33.01 
 
 
496 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  35.87 
 
 
500 aa  285  2e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.45474e-07  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  37.16 
 
 
514 aa  283  5e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  38.28 
 
 
494 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  38.02 
 
 
1031 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  32.8 
 
 
537 aa  278  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  33.33 
 
 
487 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1776  ribonuclease E  32.34 
 
 
984 aa  278  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  9.43072e-05  decreased coverage  0.00020345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  35.98 
 
 
507 aa  278  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.20175e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  34.31 
 
 
492 aa  277  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  34.29 
 
 
497 aa  276  9e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  34.29 
 
 
497 aa  276  1e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  32.59 
 
 
559 aa  275  2e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  34.24 
 
 
562 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  30.3 
 
 
525 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  34.73 
 
 
808 aa  264  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  34.31 
 
 
792 aa  264  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.40438e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  36.62 
 
 
499 aa  263  5e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  32.5 
 
 
564 aa  263  5e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  33.72 
 
 
493 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  32.46 
 
 
489 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2131  RNAse E  30.92 
 
 
936 aa  262  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162164  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0806  ribonuclease  30.59 
 
 
890 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0942815  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1321  ribonuclease E  32.29 
 
 
904 aa  259  7e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0034947  normal  0.881501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  34.3 
 
 
866 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2728  ribonuclease, Rne/Rng family  38.35 
 
 
1053 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1711  ribonuclease E  31.61 
 
 
868 aa  259  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296054  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0716  ribonuclease  30.26 
 
 
869 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.695847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6047  ribonuclease, Rne/Rng family  38.32 
 
 
1045 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  31.22 
 
 
489 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  31.22 
 
 
489 aa  258  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0732  ribonuclease, Rne/Rng family  37.2 
 
 
844 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0731  ribonuclease, Rne/Rng family  37.2 
 
 
860 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.767786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  31.85 
 
 
938 aa  256  1e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  32.2 
 
 
528 aa  255  2e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  31.81 
 
 
508 aa  254  2e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1296  ribonuclease E  31.03 
 
 
890 aa  255  2e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.17459  normal  0.956429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2149  RNAse E  32.4 
 
 
889 aa  255  2e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1353  ribonuclease E  32.43 
 
 
938 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000765938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3009  ribonuclease  38.05 
 
 
1060 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00611074  normal  0.333184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0696  ribonuclease G  36.96 
 
 
868 aa  253  8e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  33.08 
 
 
500 aa  253  8e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0738  ribonuclease  36.69 
 
 
740 aa  253  8e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3278  ribonuclease  32.35 
 
 
863 aa  253  9e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.027998  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  40.18 
 
 
702 aa  252  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4668  ribonuclease  37.6 
 
 
1080 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.156996  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0393  ribonuclease  34.52 
 
 
1092 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3659  ribonuclease  36.9 
 
 
1049 aa  252  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3946  ribonuclease, Rne/Rng family  37.13 
 
 
1065 aa  252  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.213913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4649  ribonuclease  37.5 
 
 
1043 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.332201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2376  ribonuclease, Rne/Rng family  32.16 
 
 
491 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0908  ribonuclease Rne/Rng domain-containing protein  36.69 
 
 
891 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  5.77362e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3952  ribonuclease, Rne/Rng family  36.9 
 
 
1046 aa  252  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0825957  normal  0.60191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  31.53 
 
 
501 aa  251  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2442  ribonuclease  38.82 
 
 
1043 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26344  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  38.28 
 
 
1175 aa  251  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  31.05 
 
 
528 aa  251  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2854  ribonuclease  37.97 
 
 
1029 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.541303  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  32.4 
 
 
489 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  32.4 
 
 
489 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  32.4 
 
 
489 aa  250  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4204  ribonuclease E  38.05 
 
 
1070 aa  250  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0388  ribonuclease  36.84 
 
 
906 aa  250  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  39.2 
 
 
990 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_004310  BR0912  ribonuclease Rne/Rng domain-containing protein  36.41 
 
 
922 aa  249  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00607829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1490  ribonuclease, Rne/Rng family protein  35.15 
 
 
1124 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.326409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  32.03 
 
 
489 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0957  ribonuclease  34.78 
 
 
944 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545354  normal  0.0139882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  31.66 
 
 
489 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2785  ribonuclease E  36.08 
 
 
1088 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  31.66 
 
 
489 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>