More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0007 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 595 aa  1200    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  69.27 
 
 		 638 aa  866    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  71.63 
 
 		 624 aa  902    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  60.83 
 
 		 605 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  69.36 
 
 		 607 aa  884    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  62.12 
 
 		 594 aa  766    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  70.92 
 
 		 619 aa  902    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  46.61 
 
 		 622 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.05 
 
 		 995 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  38.25 
 
 		 1029 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.62 
 
 		 990 aa  346  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  40.32 
 
 		 524 aa  345  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.04 
 
 		 991 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  38.73 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  38.48 
 
 		 533 aa  335  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  39.13 
 
 		 532 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  37.4 
 
 		 611 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  38.05 
 
 		 532 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.03 
 
 		 996 aa  329  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  38.75 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.87 
 
 		 981 aa  326  8.000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.89 
 
 		 995 aa  324  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  35.14 
 
 		 1001 aa  323  6e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  37.13 
 
 		 532 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  35.63 
 
 		 613 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  34.85 
 
 		 613 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  34.52 
 
 		 613 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.98 
 
 		 530 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  36.59 
 
 		 531 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  35.62 
 
 		 530 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  38.39 
 
 		 533 aa  313  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  36.75 
 
 		 533 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  36.75 
 
 		 521 aa  306  8.000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 		 526 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  40.28 
 
 		 473 aa  302  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  34.53 
 
 		 526 aa  301  2e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 534 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  39.22 
 
 		 530 aa  297  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  35.82 
 
 		 614 aa  296  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.75 
 
 		 525 aa  294  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  35.06 
 
 		 529 aa  294  4e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  35.8 
 
 		 623 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  34.43 
 
 		 522 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  34.55 
 
 		 625 aa  286  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  37.57 
 
 		 533 aa  286  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  32.33 
 
 		 503 aa  283  5.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  34.48 
 
 		 535 aa  283  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  35.91 
 
 		 533 aa  282  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  35.79 
 
 		 532 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  35.09 
 
 		 599 aa  281  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  34.5 
 
 		 526 aa  280  4e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  34.68 
 
 		 526 aa  280  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.53 
 
 		 991 aa  280  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  35.29 
 
 		 533 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  35.01 
 
 		 526 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.18 
 
 		 853 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  34.43 
 
 		 533 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  35.63 
 
 		 620 aa  276  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  32.97 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  33.15 
 
 		 512 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  35.03 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  35.29 
 
 		 615 aa  273  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.19 
 
 		 856 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2433  preprotein translocase subunit SecD  37.05 
 
 		 618 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2396  protein-export membrane protein SecD  32.89 
 
 		 637 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  49.16 
 
 		 532 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  33.58 
 
 		 535 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  34.81 
 
 		 604 aa  270  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  34.81 
 
 		 604 aa  270  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  34 
 
 		 609 aa  270  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  34.45 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  34.45 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  34.45 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  34.49 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  34.45 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  34.45 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  34.45 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  34.45 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  34.09 
 
 		 615 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  33.27 
 
 		 632 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  34.09 
 
 		 615 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0466  preprotein translocase subunit SecD  33.74 
 
 		 615 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0507  preprotein translocase subunit SecD  33.74 
 
 		 615 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.714923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0447  preprotein translocase subunit SecD  33.74 
 
 		 615 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  33.87 
 
 		 615 aa  267  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  33.87 
 
 		 615 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  33.87 
 
 		 604 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  34.77 
 
 		 521 aa  266  7e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.89 
 
 		 856 aa  266  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2191  preprotein translocase subunit SecD  34.67 
 
 		 616 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111681  decreased coverage  0.00360319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  33.92 
 
 		 615 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  35.18 
 
 		 607 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1021  preprotein translocase subunit SecD  34.04 
 
 		 604 aa  264  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  35.24 
 
 		 607 aa  264  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  34.46 
 
 		 533 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  33.21 
 
 		 535 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  33.83 
 
 		 500 aa  260  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  33.76 
 
 		 636 aa  260  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  46.69 
 
 		 534 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  44.24 
 
 		 510 aa  259  7e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>