236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0004 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  81.08 
 
 
407 aa  707  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  81.57 
 
 
407 aa  720  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  77.89 
 
 
407 aa  689  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  79.85 
 
 
407 aa  699  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  76.9 
 
 
425 aa  676  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  100 
 
 
407 aa  847  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  81.82 
 
 
407 aa  712  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  44.64 
 
 
397 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.25791e-05  hitchhiker  6.1463e-07 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  47.33 
 
 
400 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  45.93 
 
 
399 aa  355  8e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  42.09 
 
 
508 aa  355  8e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  44.86 
 
 
878 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  45.67 
 
 
399 aa  353  3e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  44.61 
 
 
878 aa  352  9e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  42.96 
 
 
884 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  41.97 
 
 
395 aa  322  9e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  41.71 
 
 
395 aa  318  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  39.19 
 
 
431 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  39.19 
 
 
421 aa  313  4e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  39.39 
 
 
409 aa  312  6e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  40.4 
 
 
395 aa  312  8e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.74578e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  39.85 
 
 
423 aa  307  2e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 
396 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.65819e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  36.69 
 
 
571 aa  262  7e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 
387 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.74 
 
 
575 aa  235  1e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.11 
 
 
576 aa  234  2e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
387 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  32.59 
 
 
399 aa  233  4e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  7.05459e-05 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.08 
 
 
397 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.36277e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.46 
 
 
576 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  33.25 
 
 
403 aa  232  7e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
387 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.75 
 
 
396 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.11538e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.58 
 
 
405 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.07 
 
 
401 aa  226  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  34.78 
 
 
575 aa  226  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.67 
 
 
402 aa  226  5e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 
387 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 
392 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  33.08 
 
 
579 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  33.42 
 
 
395 aa  223  5e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.7389e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.79 
 
 
397 aa  223  5e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.77 
 
 
575 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.77 
 
 
575 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  33.67 
 
 
393 aa  221  2e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  32.17 
 
 
404 aa  219  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.47 
 
 
582 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.16 
 
 
396 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  34.53 
 
 
576 aa  215  1e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.22 
 
 
572 aa  215  1e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  32.74 
 
 
589 aa  213  4e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  33.25 
 
 
387 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  32.18 
 
 
575 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.12 
 
 
575 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.4 
 
 
574 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  36.11 
 
 
638 aa  210  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  31.2 
 
 
404 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
402 aa  209  9e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
591 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
404 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.96505e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.25 
 
 
498 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  30.71 
 
 
404 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  8.71777e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.83 
 
 
479 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  31.16 
 
 
392 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 
479 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  34.57 
 
 
591 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
404 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
407 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.58 
 
 
479 aa  206  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.58 
 
 
479 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  30.58 
 
 
479 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.89 
 
 
504 aa  206  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.58 
 
 
479 aa  206  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 
402 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.58 
 
 
479 aa  206  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  31.39 
 
 
398 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.58 
 
 
479 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.83 
 
 
493 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  32.56 
 
 
574 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.33 
 
 
400 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 
396 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.58 
 
 
479 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  29.44 
 
 
582 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.58 
 
 
479 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.35155e-06 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  31.77 
 
 
592 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.58 
 
 
479 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.58 
 
 
479 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.12 
 
 
479 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.85 
 
 
500 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00441  flavoprotein  34 
 
 
591 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  32.28 
 
 
591 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  34 
 
 
591 aa  202  1e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
405 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.9 
 
 
505 aa  200  4e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.15 
 
 
494 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.33 
 
 
479 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 
396 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.08 
 
 
482 aa  199  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  30.6 
 
 
397 aa  199  1e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>