37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0003 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  60.82 
 
 
97 aa  135  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  51.55 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  47.31 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  47.42 
 
 
97 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  42.27 
 
 
97 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  40.86 
 
 
96 aa  87.8  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  29.35 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  30.11 
 
 
153 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  29.79 
 
 
179 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  37.7 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  32.56 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  29.03 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  32.98 
 
 
287 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  31.25 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  30.23 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  35.94 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  34.67 
 
 
300 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  26.37 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  29.76 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  30.49 
 
 
188 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  26.88 
 
 
217 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  25.64 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  30 
 
 
266 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  27.78 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  24.36 
 
 
201 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  38.71 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  32.81 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  28.72 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  27.37 
 
 
106 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  28.26 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  32.88 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  24.44 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0397  hypothetical protein  29.73 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  24.36 
 
 
198 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  29.67 
 
 
152 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>