More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0002 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  100 
 
 
369 aa  753  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  50.68 
 
 
369 aa  400  1e-110  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  49.44 
 
 
363 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  48.48 
 
 
363 aa  353  3e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  49.57 
 
 
365 aa  352  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  49.14 
 
 
364 aa  346  3e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  46.29 
 
 
370 aa  317  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  36.06 
 
 
375 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  35.77 
 
 
375 aa  222  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  35.77 
 
 
375 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  35.49 
 
 
375 aa  221  2e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  35.49 
 
 
375 aa  221  2e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  35.49 
 
 
375 aa  221  2e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  35.49 
 
 
375 aa  221  2e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  35.49 
 
 
375 aa  221  2e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  35.49 
 
 
375 aa  221  2e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  35.63 
 
 
375 aa  219  4e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  35.41 
 
 
387 aa  212  8e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  35.39 
 
 
373 aa  212  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  34.34 
 
 
372 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  34.96 
 
 
374 aa  208  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.27 
 
 
376 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  34.1 
 
 
371 aa  205  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  32.76 
 
 
374 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  32.35 
 
 
359 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  34.94 
 
 
365 aa  197  4e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  33.15 
 
 
370 aa  196  5e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  33.15 
 
 
370 aa  196  5e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.95 
 
 
372 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.91 
 
 
373 aa  192  6e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.14 
 
 
365 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  31.92 
 
 
370 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  32.88 
 
 
398 aa  190  3e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  32.76 
 
 
374 aa  189  9e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 
360 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  29.97 
 
 
361 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  29.97 
 
 
361 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  30.64 
 
 
374 aa  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  32.77 
 
 
365 aa  185  1e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  30.73 
 
 
364 aa  184  2e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  33.8 
 
 
373 aa  182  9e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  31.25 
 
 
367 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  2.41058e-09 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  28.53 
 
 
362 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.73 
 
 
364 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  31.73 
 
 
364 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  33.96 
 
 
394 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  31.1 
 
 
359 aa  176  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.42 
 
 
382 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  29.8 
 
 
369 aa  174  2e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  30.86 
 
 
366 aa  174  2e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  30.99 
 
 
369 aa  174  2e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  32.47 
 
 
371 aa  174  3e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  31.36 
 
 
377 aa  173  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  29.18 
 
 
368 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  29.26 
 
 
370 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.06 
 
 
386 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  31.52 
 
 
359 aa  171  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  29.91 
 
 
364 aa  171  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  32.11 
 
 
370 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.52 
 
 
360 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.09 
 
 
375 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  31.43 
 
 
360 aa  165  1e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  30.25 
 
 
390 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  3.32989e-05  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  30.86 
 
 
368 aa  163  4e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.76 
 
 
371 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  28.4 
 
 
365 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  30.65 
 
 
392 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.69 
 
 
377 aa  156  5e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.25 
 
 
381 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  30.75 
 
 
386 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  28.68 
 
 
401 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  27.59 
 
 
414 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.15 
 
 
390 aa  154  3e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  28.64 
 
 
402 aa  154  3e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  30.17 
 
 
377 aa  153  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.83 
 
 
358 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  30.2 
 
 
371 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  31.48 
 
 
363 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  29.09 
 
 
386 aa  146  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.19 
 
 
372 aa  145  8e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.19 
 
 
372 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  27.87 
 
 
365 aa  145  1e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  27.27 
 
 
378 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  29.2 
 
 
380 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  29.2 
 
 
380 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  28.61 
 
 
389 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.42 
 
 
362 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.15018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.77 
 
 
391 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  29.55 
 
 
377 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  28.08 
 
 
371 aa  143  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  29.2 
 
 
380 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  31.84 
 
 
357 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  30 
 
 
365 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  28 
 
 
371 aa  142  1e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.46 
 
 
397 aa  142  1e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.28 
 
 
369 aa  141  2e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.2 
 
 
379 aa  141  2e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.61 
 
 
380 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  29.12 
 
 
340 aa  140  5e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.24 
 
 
378 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>