More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4144 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 368 aa  742    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50.85 
 
 		 427 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.88 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  50 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  49.12 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.05 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.05 
 
 		 354 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.05 
 
 		 354 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  48.54 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  48.27 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.91 
 
 		 417 aa  291  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  48.09 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  47.76 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  48.58 
 
 		 387 aa  289  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.11 
 
 		 371 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.84 
 
 		 362 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  49.3 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 372 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  48.69 
 
 		 355 aa  288  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  47.87 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 353 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 370 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 428 aa  285  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 428 aa  285  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 428 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.02 
 
 		 346 aa  285  8e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.85 
 
 		 426 aa  285  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  45.56 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  48.85 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  47.4 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  46.94 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  47.66 
 
 		 408 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  47.66 
 
 		 408 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  49.29 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.55 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  47.38 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  44.75 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  47.27 
 
 		 370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  47.38 
 
 		 408 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  47.28 
 
 		 428 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 428 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  45.58 
 
 		 395 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  47.94 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  47.67 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  46.99 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.29 
 
 		 435 aa  280  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.79 
 
 		 407 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  46.39 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  45.56 
 
 		 434 aa  280  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  51.03 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  47.35 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  46.45 
 
 		 341 aa  279  7e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  46.45 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  48.4 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  48.04 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  50 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  48.26 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  48.99 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  50 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  47.11 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  48.21 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  48.06 
 
 		 364 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  47.42 
 
 		 338 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.83 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  46.41 
 
 		 407 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  46.69 
 
 		 407 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.56 
 
 		 464 aa  275  9e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  47.76 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.75 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  49.13 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  49.13 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  49.69 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  47.92 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  47.65 
 
 		 406 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.75 
 
 		 463 aa  272  9e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.69 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  48.52 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  47.93 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  47.81 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  47.81 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>