152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4133 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4133  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 		 840 aa  1691    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  27.33 
 
 		 650 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.14 
 
 		 637 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  30.72 
 
 		 523 aa  95.5  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  33.5 
 
 		 635 aa  94.4  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  35.14 
 
 		 614 aa  93.6  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  28.21 
 
 		 629 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1599  GTP-binding protein, HSR1-related  37.32 
 
 		 500 aa  92.8  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.17 
 
 		 512 aa  93.2  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  32 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  31.65 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  37.19 
 
 		 495 aa  57  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.8 
 
 		 405 aa  56.2  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  31.2 
 
 		 403 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 495 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0421  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 		 437 aa  54.3  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0613118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  31.62 
 
 		 408 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 494 aa  54.3  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.6 
 
 		 402 aa  53.5  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  29.79 
 
 		 580 aa  53.5  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  36.72 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  28.91 
 
 		 411 aa  52.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  36.29 
 
 		 490 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  33.61 
 
 		 500 aa  52  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  30.84 
 
 		 494 aa  52  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  34.4 
 
 		 495 aa  52  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  34.4 
 
 		 495 aa  52  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  34.4 
 
 		 495 aa  52  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  27.5 
 
 		 398 aa  51.6  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 443 aa  51.2  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2356  GTP-binding protein EngA  30.12 
 
 		 437 aa  50.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  29.66 
 
 		 557 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  30 
 
 		 436 aa  50.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  32.58 
 
 		 498 aa  50.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1176  small GTP-binding protein  36.36 
 
 		 392 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668458  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  28.33 
 
 		 452 aa  50.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  36.36 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1096  GTP-binding proten HflX  36.36 
 
 		 392 aa  50.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  29.66 
 
 		 557 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  27.45 
 
 		 303 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  33.64 
 
 		 441 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  36.36 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  31.43 
 
 		 454 aa  49.7  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  32.79 
 
 		 498 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  31.58 
 
 		 416 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  31.43 
 
 		 454 aa  49.7  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  26.61 
 
 		 496 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  27.84 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.08 
 
 		 516 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  27.52 
 
 		 455 aa  49.3  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6542  small GTP-binding protein  31.19 
 
 		 441 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1172  GTP-binding protein EngA  32.71 
 
 		 489 aa  49.3  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.120565  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 497 aa  49.3  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  33.64 
 
 		 389 aa  48.9  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  32.03 
 
 		 425 aa  48.9  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  32.76 
 
 		 511 aa  48.9  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2013  GTP-binding protein EngA  31.67 
 
 		 437 aa  48.9  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  33.64 
 
 		 494 aa  48.9  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  30.47 
 
 		 307 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 494 aa  48.9  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  29.53 
 
 		 443 aa  48.9  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  35.85 
 
 		 1058 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  31.78 
 
 		 441 aa  48.5  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  34.59 
 
 		 490 aa  48.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  32.31 
 
 		 454 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  29.78 
 
 		 297 aa  48.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  25.2 
 
 		 301 aa  48.1  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  29.82 
 
 		 443 aa  48.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  27.56 
 
 		 868 aa  47.8  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0371  translation initiation factor IF-2  29.25 
 
 		 896 aa  47.8  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  26.52 
 
 		 845 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  30.86 
 
 		 451 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  30.51 
 
 		 471 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0011  GTP-binding protein EngA  31.78 
 
 		 472 aa  47.4  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.162557  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  31.09 
 
 		 434 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  35.51 
 
 		 488 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  33.1 
 
 		 454 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  29.57 
 
 		 458 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  33.96 
 
 		 953 aa  47.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  29.23 
 
 		 413 aa  47.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  33.64 
 
 		 481 aa  47.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  27.18 
 
 		 297 aa  47.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  26.97 
 
 		 435 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  29.6 
 
 		 498 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  27.56 
 
 		 868 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  21.56 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  27.11 
 
 		 880 aa  46.2  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3122  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  25.85 
 
 		 461 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  32.71 
 
 		 442 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 436 aa  46.6  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  23.38 
 
 		 295 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  29.32 
 
 		 354 aa  46.2  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl469  GTP-binding membrane protein, elongation factor  25.45 
 
 		 612 aa  46.2  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000135836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>