More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3995 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 411 aa  854    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.59 
 
 		 411 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.11 
 
 		 411 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.11 
 
 		 411 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.25 
 
 		 411 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  70.27 
 
 		 411 aa  622  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  70.86 
 
 		 411 aa  620  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.8 
 
 		 411 aa  618  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.53 
 
 		 411 aa  615  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.38 
 
 		 408 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  67.66 
 
 		 417 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.64 
 
 		 408 aa  593  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.68 
 
 		 408 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.43 
 
 		 408 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.43 
 
 		 408 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  64.94 
 
 		 408 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.59 
 
 		 410 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  64.62 
 
 		 410 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  64.62 
 
 		 410 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.73 
 
 		 408 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.97 
 
 		 408 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  64.86 
 
 		 410 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  64.13 
 
 		 410 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.88 
 
 		 410 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.14 
 
 		 410 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.14 
 
 		 411 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.14 
 
 		 411 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.46 
 
 		 531 aa  541  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.74 
 
 		 409 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.7 
 
 		 408 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.6 
 
 		 409 aa  532  1e-150  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.84 
 
 		 411 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.9 
 
 		 407 aa  531  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.95 
 
 		 407 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.27 
 
 		 407 aa  522  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.72 
 
 		 404 aa  512  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  55.39 
 
 		 408 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.06 
 
 		 409 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.91 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  46.34 
 
 		 443 aa  342  9e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  43.92 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.49 
 
 		 393 aa  293  6e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  31.46 
 
 		 390 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  31.41 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  31.19 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.94 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.51 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.51 
 
 		 389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.35 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.67 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  31.07 
 
 		 395 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.27 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.78 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.85 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.1 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  25.76 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  27.98 
 
 		 391 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  27.79 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  28.47 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  27.56 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.45 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.63 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  29.68 
 
 		 384 aa  137  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  28.05 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.05 
 
 		 388 aa  135  9e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  27.82 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  28.2 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  28.2 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  28.2 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  28.2 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  28.2 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  28.04 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  27.82 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  27.94 
 
 		 392 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  28.46 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  28.53 
 
 		 392 aa  131  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.53 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  29 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  28.01 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  28.39 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  29.68 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  28.2 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  29 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  29.6 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  25.73 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  28.16 
 
 		 391 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  27.15 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.03 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  27.09 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  26.89 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  26.23 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 		 382 aa  120  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  27.34 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  29.57 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  27.67 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  27.67 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  26.91 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  25.54 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  25.06 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>