More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3991 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 305 aa  618  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  46.74 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  43.17 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  42.24 
 
 		 235 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  43.17 
 
 		 234 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  36.9 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  39.93 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  52.74 
 
 		 226 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  33.58 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  41.79 
 
 		 234 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  42.86 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  43.65 
 
 		 209 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  43.65 
 
 		 209 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  36.99 
 
 		 211 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  45.13 
 
 		 199 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  58.33 
 
 		 196 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  37.4 
 
 		 219 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  30.62 
 
 		 209 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  40.68 
 
 		 225 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  55.13 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  44.25 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  36.92 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  41.13 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  47.79 
 
 		 199 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  46.02 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  52.11 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  38.98 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1660  cytochrome c oxidase, subunit III  27.63 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  39.36 
 
 		 832 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2954  cytochrome c oxidase subunit III  30.43 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.179813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  45.33 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  52.05 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  27.24 
 
 		 193 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  24.4 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  27.24 
 
 		 193 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  27.24 
 
 		 193 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  24.63 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  39.81 
 
 		 825 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  32.5 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  32.5 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  43.06 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  25.19 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  25.18 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  42.47 
 
 		 200 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  30.77 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  36 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  42.42 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  40 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  24.9 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  45.45 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  37.65 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  36.36 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  45.83 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  37.97 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  48.61 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  48.61 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  36.47 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  46.38 
 
 		 827 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  42.25 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  41.67 
 
 		 194 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  45.83 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  30.84 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  40.85 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  31.58 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  39.73 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  40.28 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  24.71 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  40.91 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  40 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  48.61 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  40.85 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  42.42 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  43.06 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  34.62 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  44.59 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  42.65 
 
 		 819 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  34.62 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  36.62 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  34.62 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  29.49 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  34.62 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  34.62 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  42.31 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  39.39 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  35.44 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  39.39 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  38.03 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  35.44 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  39.39 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  34.62 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  34.18 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  39.39 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  42.47 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  39.39 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  34.62 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  35.71 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  37.5 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>