More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3990 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  62.96 
 
 		 548 aa  672    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  67.7 
 
 		 556 aa  736    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  62.33 
 
 		 552 aa  664    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  60.95 
 
 		 565 aa  656    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 564 aa  1135    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  60.38 
 
 		 542 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  58.4 
 
 		 535 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  59.53 
 
 		 544 aa  620  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  56.04 
 
 		 545 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  61.87 
 
 		 554 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  62.06 
 
 		 555 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  55.64 
 
 		 563 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  62.06 
 
 		 555 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  55.64 
 
 		 563 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  55.64 
 
 		 563 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  55.56 
 
 		 558 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  57.39 
 
 		 540 aa  595  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  54.87 
 
 		 565 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  58.69 
 
 		 541 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  58.32 
 
 		 539 aa  588  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  53.75 
 
 		 558 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  57.85 
 
 		 557 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  57.58 
 
 		 555 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  54.39 
 
 		 554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  57.14 
 
 		 541 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  57.68 
 
 		 541 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  56.95 
 
 		 541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  55 
 
 		 554 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  55 
 
 		 554 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  55.18 
 
 		 554 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  52.65 
 
 		 558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  54.92 
 
 		 539 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  57.2 
 
 		 543 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  56.92 
 
 		 543 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  56.02 
 
 		 542 aa  537  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  56.14 
 
 		 528 aa  533  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  43.6 
 
 		 615 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  46.97 
 
 		 641 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  46.77 
 
 		 641 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  43.98 
 
 		 548 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  44.64 
 
 		 587 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  43.76 
 
 		 590 aa  452  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  43.79 
 
 		 541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  45.16 
 
 		 638 aa  442  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  42.94 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  43.52 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  43.92 
 
 		 534 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  42.49 
 
 		 543 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  43.93 
 
 		 560 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  44.47 
 
 		 564 aa  440  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  45.78 
 
 		 806 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  43.62 
 
 		 575 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  43.33 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  42.7 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  41.64 
 
 		 558 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  43.05 
 
 		 539 aa  438  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  45.6 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  43.04 
 
 		 552 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  43.64 
 
 		 544 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  43.64 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  43.33 
 
 		 530 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  43.53 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  42.94 
 
 		 531 aa  433  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  43.5 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  43.14 
 
 		 546 aa  435  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  43.53 
 
 		 555 aa  435  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  43.55 
 
 		 547 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  42.94 
 
 		 530 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  43.5 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  44.08 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  42.75 
 
 		 530 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  42.94 
 
 		 531 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  43.88 
 
 		 544 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  42.94 
 
 		 530 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  43.92 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  42.94 
 
 		 530 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  43.3 
 
 		 541 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  43.33 
 
 		 530 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  43.33 
 
 		 530 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  43.33 
 
 		 530 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  43.22 
 
 		 536 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  42.75 
 
 		 534 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  43.8 
 
 		 555 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  43.92 
 
 		 539 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  42.7 
 
 		 565 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  43.8 
 
 		 555 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  44.64 
 
 		 535 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  43.14 
 
 		 556 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  44.09 
 
 		 526 aa  432  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  44.05 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  44.25 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  43.03 
 
 		 534 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  44.25 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  43.53 
 
 		 544 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  44.25 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  41.83 
 
 		 546 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  44.05 
 
 		 535 aa  429  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  41.83 
 
 		 546 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  44.05 
 
 		 535 aa  429  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>