More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3931 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  100 
 
 
407 aa  837    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  42.62 
 
 
361 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  41.83 
 
 
359 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  35.08 
 
 
363 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  39.94 
 
 
367 aa  226  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  34.08 
 
 
380 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  33.5 
 
 
873 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  34.47 
 
 
1016 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  35.26 
 
 
402 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  34.14 
 
 
405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  34.14 
 
 
405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  34.92 
 
 
406 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.85 
 
 
376 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  31.54 
 
 
451 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  32.36 
 
 
414 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.04 
 
 
415 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  30.94 
 
 
412 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  31.92 
 
 
369 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  32.08 
 
 
866 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.33 
 
 
420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  34.81 
 
 
401 aa  155  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  34.3 
 
 
403 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  31.82 
 
 
369 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  34.13 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  31.23 
 
 
600 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  31.07 
 
 
369 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.33 
 
 
416 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.31 
 
 
410 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.65 
 
 
412 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.44 
 
 
446 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.65 
 
 
412 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.79 
 
 
409 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  33.63 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  33.63 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  28.78 
 
 
410 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.44 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.44 
 
 
403 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.13 
 
 
401 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  33.23 
 
 
414 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.24 
 
 
416 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  31.19 
 
 
457 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  33.64 
 
 
431 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.26 
 
 
411 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  30 
 
 
891 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.41 
 
 
417 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.16 
 
 
414 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.89 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  32.05 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  33.54 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.44 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.73 
 
 
408 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.74 
 
 
417 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.95 
 
 
335 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.53 
 
 
400 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 
402 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3554  predicted protein  30.34 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298587  normal  0.425378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  30.59 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  34.35 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.53 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  32.62 
 
 
429 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  33.95 
 
 
369 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.84 
 
 
406 aa  132  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  29.74 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  35.69 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.14 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  29.48 
 
 
461 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  29.48 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  32.23 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.42 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  30.72 
 
 
409 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.94 
 
 
408 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.85 
 
 
408 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  28.09 
 
 
430 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.86 
 
 
430 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  30.99 
 
 
425 aa  122  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.47 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.99 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.28 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  31.86 
 
 
419 aa  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  31.21 
 
 
424 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  31.37 
 
 
431 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.86 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.74 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.74 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  28.28 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  30.8 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  29.2 
 
 
408 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  30.74 
 
 
418 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  30.29 
 
 
379 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.83 
 
 
501 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  31.72 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  29.04 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  30.45 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.41 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  33.95 
 
 
406 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  30.55 
 
 
414 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  30.58 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>